More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00243 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00243  two-component VirA-like sensor kinase  100 
 
 
810 aa  1611    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3904  two-component VirA-like sensor kinase  33.94 
 
 
829 aa  297  6e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2107  two-component VirA-like sensor kinase  31.39 
 
 
820 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4383  two-component VirA-like sensor kinase  29.74 
 
 
838 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
814 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 
914 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 
571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 
571 aa  178  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
1275 aa  177  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
1040 aa  177  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 
1419 aa  177  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1309 aa  173  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1102 aa  171  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
583 aa  170  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
721 aa  169  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
1342 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
642 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.33 
 
 
823 aa  165  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
1184 aa  164  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1194 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  32.33 
 
 
1268 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
886 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
997 aa  161  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
1184 aa  161  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
795 aa  160  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2731  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
1007 aa  160  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 
711 aa  160  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2766  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 
717 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.947572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
991 aa  160  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
1140 aa  160  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
871 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
953 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
1113 aa  159  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
931 aa  159  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2469  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
655 aa  158  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344805  normal  0.830162 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
1079 aa  158  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 
829 aa  158  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.73 
 
 
819 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
981 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  31.89 
 
 
1109 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
643 aa  157  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 
997 aa  156  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 
770 aa  156  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 
1193 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  33.68 
 
 
787 aa  155  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
650 aa  155  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
1023 aa  155  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
886 aa  154  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
802 aa  154  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  30.65 
 
 
654 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8250  two-component VirA-like sensor kinase  34.88 
 
 
847 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467726  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
1151 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.07 
 
 
1121 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  29.35 
 
 
882 aa  151  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
871 aa  151  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 
925 aa  151  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0297  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
711 aa  151  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.219152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
893 aa  151  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 
869 aa  150  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
692 aa  150  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  31.19 
 
 
1112 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
1108 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
1115 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
692 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 
1023 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
810 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
1677 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
837 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
860 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
776 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
826 aa  149  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
912 aa  149  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1509 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 
770 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 
584 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
503 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.534636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.72 
 
 
890 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 
817 aa  147  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 
885 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1191 aa  147  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
880 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 
812 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4481  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
737 aa  146  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.913087  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
777 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 
753 aa  147  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  32.67 
 
 
1015 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 
1019 aa  146  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
817 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 
827 aa  145  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
738 aa  145  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
654 aa  145  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  28.39 
 
 
1427 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 
823 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
656 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 
1426 aa  145  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
751 aa  145  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
1134 aa  145  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
759 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
814 aa  144  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
637 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>