More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3755 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_3755  predicted protein  100 
 
 
307 aa  634    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.278 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58121  predicted protein  45.63 
 
 
415 aa  255  6e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00956  dihydrouridine synthase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16550)  47.96 
 
 
563 aa  248  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.89496 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04140  tRNA dihydrouridine synthase, putative  47.5 
 
 
610 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.663253  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_3015  predicted protein  47.01 
 
 
233 aa  211  9e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33532  dihydrouridine synthase  38.13 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.056699  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_4048  predicted protein  41.23 
 
 
229 aa  166  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4049  predicted protein  41.23 
 
 
229 aa  166  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0150728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1003  hypothetical protein  37.55 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3612  TIM-barrel protein, nifR3 family  36.8 
 
 
357 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.807702  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2154  dihydrouridine synthase, DuS  36.04 
 
 
318 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000009638  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2783  putative dihydrouridine synthase  29.89 
 
 
326 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2469  putative dihydrouridine synthase  29.89 
 
 
326 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23375  predicted protein  30.09 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000883702  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2560  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.85 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0645  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  36.91 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.446085  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0172  nifR3 family TIM-barrel protein  37.23 
 
 
319 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000224205  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2449  TIM-barrel protein  36.96 
 
 
351 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102177  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0242  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  32.95 
 
 
348 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0191961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0914  nifR3 family TIM-barrel protein  31.77 
 
 
347 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2788  TIM-barrel protein, nifR3 family  32.74 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00335838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0161  TIM-barrel protein, nifR3 family  36.32 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141339  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0025  NifR3 family protein  27.74 
 
 
320 aa  125  7e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1005  dihydrouridine synthase family protein  30.32 
 
 
325 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.667167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0425  NifR3 family TIM-barrel protein  32.48 
 
 
324 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0176336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7030  TIM-barrel protein, nifR3 family  35.25 
 
 
379 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.417643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5928  NifR3 family TIM-barrel protein  34.62 
 
 
358 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3447  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.47 
 
 
337 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2838  tRNA-dihydrouridine synthase B  32.94 
 
 
322 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00370185  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2288  nifR3 family TIM-barrel protein  34.21 
 
 
347 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2343  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.72 
 
 
328 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2807  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.47 
 
 
321 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00690  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  29.59 
 
 
333 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1926  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  29.31 
 
 
351 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0994429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03937  tRNA-dihydrouridine synthase B  30.85 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259416  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0276  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  32.33 
 
 
354 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2942  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.47 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1325  nifR3 family TIM-barrel protein  34.19 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.544118  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1810  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.77 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752321  hitchhiker  0.00592071 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1650  TIM-barrel protein, nifR3 family  35.27 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  0.0220296 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl029  tRNA dihydrouridine synthetase  31.86 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2561  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  32.88 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000534823 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0487  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.62 
 
 
353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3448  nifR3 family TIM-barrel protein  34.01 
 
 
332 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1277  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  31.14 
 
 
332 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360448  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3680  dihydrouridine synthase DuS  32.74 
 
 
322 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2132  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.93 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1252  dihydrouridine synthase  31.64 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0403  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.44 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000189855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0864  nifR3 family TIM-barrel protein  30.68 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0279  tRNA-dihydrouridine synthase  31.76 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.690235  hitchhiker  0.007193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2936  TIM-barrel protein, nifR3 family  32.31 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123806  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10310  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  30.4 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.193475  unclonable  0.00000000180311 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0837  tRNA-dihydrouridine synthase  30.26 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3790  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  34.21 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0373  putative tRNA-dihydrouridine synthase  31.28 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2132  nitrogen regulation protein  30.43 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296899  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0626  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.21 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4401  nifR3 family TIM-barrel protein  34.91 
 
 
345 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2818  NifR3 family TIM-barrel protein  32.61 
 
 
342 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.404964 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0758  putative tRNA-dihydrouridine synthase  31.18 
 
 
317 aa  117  3e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.164456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1464  nifR3 family TIM-barrel protein  28.17 
 
 
362 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00679382  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0527  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.78 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3225  tRNA-dihydrouridine synthase B  31.06 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000851136  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2368  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.89 
 
 
336 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2418  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.89 
 
 
336 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0154  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.26 
 
 
351 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.386223  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3670  nifR3 family TIM-barrel protein  31.34 
 
 
336 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1403  TIM-barrel protein, nifR3 family  27.31 
 
 
321 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126451 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1867  TIM-barrel protein, nifR3 family  29.52 
 
 
326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.712125  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1617  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.07 
 
 
315 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2184  TIM-barrel protein, nifR3 family  34.96 
 
 
346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.067096  normal  0.397805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0363  nifR3 family TIM-barrel protein  32.28 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0074  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.72 
 
 
333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12384  predicted protein  33.19 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0273  nifR3 family TIM-barrel protein  30.8 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0075  NifR3 family TIM-barrel protein  31.7 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0316  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  31.18 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.932941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0075  NifR3 family TIM-barrel protein  31.7 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1676  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  34.33 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2685  nifR3 family TIM-barrel protein  29.6 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000366446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0612  NifR3 family TIM-barrel protein  30.91 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2691  NifR3 family TIM-barrel protein  30.94 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1992  dihydrouridine synthase  29.8 
 
 
342 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1169  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  32.08 
 
 
318 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0209  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  30.91 
 
 
355 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0270  nifR3 family TIM-barrel protein  30.25 
 
 
333 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0660  NifR3 family TIM-barrel protein  30.91 
 
 
355 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0586  nifR3 family TIM-barrel protein  30.91 
 
 
355 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64180  hypothetical protein  31.6 
 
 
332 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0693  nifR3 family TIM-barrel protein  30.91 
 
 
355 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0245  nifR3 family TIM-barrel protein  31.03 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0071  nifR3 family TIM-barrel protein  31.25 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1525  nifR3 family TIM-barrel protein  28.92 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000166 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0374  dihydrouridine synthase, DuS  33.48 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.918331  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3779  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  30.91 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5572  hypothetical protein  31.6 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1724  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  29.97 
 
 
330 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04411  tRNA-dihydrouridine synthase  30.32 
 
 
330 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.324632  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0131  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  33.88 
 
 
337 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>