More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_00956 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00956  dihydrouridine synthase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16550)  100 
 
 
563 aa  1174    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.89496 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58121  predicted protein  50.33 
 
 
415 aa  299  7e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04140  tRNA dihydrouridine synthase, putative  50.68 
 
 
610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.663253  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3755  predicted protein  47.96 
 
 
307 aa  247  4e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.278 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_3015  predicted protein  40.86 
 
 
233 aa  187  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4049  predicted protein  37.89 
 
 
229 aa  138  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_4048  predicted protein  37.89 
 
 
229 aa  138  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33532  dihydrouridine synthase  28.63 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.056699  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23375  predicted protein  33.33 
 
 
323 aa  110  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000883702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1003  hypothetical protein  31.5 
 
 
323 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl029  tRNA dihydrouridine synthetase  35.75 
 
 
325 aa  102  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3612  TIM-barrel protein, nifR3 family  35.96 
 
 
357 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.807702  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1325  nifR3 family TIM-barrel protein  36.16 
 
 
334 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.544118  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0154  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.42 
 
 
351 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.386223  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0172  nifR3 family TIM-barrel protein  30.74 
 
 
319 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000224205  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2154  dihydrouridine synthase, DuS  34.48 
 
 
318 aa  96.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000009638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3447  TIM-barrel protein, nifR3 family  35.84 
 
 
337 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0645  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  33.9 
 
 
350 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.446085  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0837  tRNA-dihydrouridine synthase  31.77 
 
 
308 aa  95.5  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0864  nifR3 family TIM-barrel protein  29.73 
 
 
349 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1926  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  27.56 
 
 
351 aa  94.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0994429  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10981  nitrogen regulation protein NifR3 family-like protein  30.83 
 
 
335 aa  93.6  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0914  nifR3 family TIM-barrel protein  35.75 
 
 
347 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1724  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  33.52 
 
 
330 aa  92  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02240  conserved hypothetical protein  33.72 
 
 
407 aa  91.3  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.12016  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10981  nitrogen regulation protein NifR3 family-like protein  30.45 
 
 
335 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2449  TIM-barrel protein  33.9 
 
 
351 aa  91.3  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102177  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04411  tRNA-dihydrouridine synthase  32.95 
 
 
330 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.324632  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002975  tRNA-dihydrouridine synthase C  31.79 
 
 
319 aa  90.9  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.386043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1303  NifR3/Smm1 family protein  35.43 
 
 
322 aa  90.9  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0734085 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1019  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  37.43 
 
 
335 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1005  dihydrouridine synthase family protein  31.61 
 
 
325 aa  88.6  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.667167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2152  tRNA-dihydrouridine synthase C  33.53 
 
 
315 aa  87.8  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02933  hypothetical protein  31.79 
 
 
319 aa  88.2  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10941  nitrogen regulation protein NifR3 family-like protein  28.73 
 
 
335 aa  87.4  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48953  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0487  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.33 
 
 
353 aa  87  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663331 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2309  dihydrouridine synthase, DuS  33.89 
 
 
317 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0075  NifR3 family TIM-barrel protein  31.75 
 
 
324 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1079  dihydrouridine synthase DuS  34.24 
 
 
328 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.224362  normal  0.224142 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0075  NifR3 family TIM-barrel protein  31.75 
 
 
324 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0283  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  33.79 
 
 
334 aa  86.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21571  putative nitrogen regulation protein NifR3 family protein  35.81 
 
 
336 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2818  NifR3 family TIM-barrel protein  31.34 
 
 
342 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.404964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0527  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.72 
 
 
327 aa  86.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0071  nifR3 family TIM-barrel protein  31.75 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2006  NifR3/Smm1 family protein  32.95 
 
 
315 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0642  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  35.57 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7030  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.89 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.417643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1813  nifR3 family TIM-barrel protein  32.77 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1676  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  33.14 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5233  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  31.75 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.471264  hitchhiker  0.000000472201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0161  TIM-barrel protein, nifR3 family  32.18 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141339  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12384  predicted protein  32.02 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0074  NifR3 family TIM-barrel protein  31.75 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0071  NifR3 family TIM-barrel protein  31.75 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0071  NifR3 family TIM-barrel protein  31.75 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0083  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  31.22 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1786  dihydrouridine synthase DuS  33.53 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000927227 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0087  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  31.75 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.811614  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2388  dihydrouridine synthase, DuS  32.78 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0313315  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2030  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  37.29 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0084  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  31.75 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000319456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6537  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.63 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2368  TIM-barrel protein, nifR3 family  34.25 
 
 
336 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1300  NifR3 family TIM-barrel protein  27.95 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1078  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  27.95 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.165746  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1501  dihydrouridine synthase DuS  33.14 
 
 
319 aa  84  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2418  TIM-barrel protein, nifR3 family  34.25 
 
 
336 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2807  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.46 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2242  dihydrouridine synthase, DuS  33.14 
 
 
309 aa  84  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000197491  hitchhiker  0.000869385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1403  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.46 
 
 
321 aa  84  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2936  TIM-barrel protein, nifR3 family  32.26 
 
 
342 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123806  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2742  tRNA-dihydrouridine synthase C  35.03 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.212051  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2452  dihydrouridine synthase, DuS  32.37 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334795  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1691  TIM-barrel protein, nifR3 family  26.12 
 
 
333 aa  83.2  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1762  dihydrouridine synthase DuS  32.6 
 
 
317 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0181198  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4068  putative tRNA-dihydrouridine synthase (nitrogen regulation protein nifR3)  35.37 
 
 
317 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.417237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2581  dihydrouridine synthase DuS  32.6 
 
 
317 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.601403  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2622  dihydrouridine synthase DuS  32.78 
 
 
317 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0113547  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0242  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  32.96 
 
 
348 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0191961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2783  putative dihydrouridine synthase  30.17 
 
 
326 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2469  putative dihydrouridine synthase  30.17 
 
 
326 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2261  dihydrouridine synthase, DuS  32.37 
 
 
315 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.214187  normal  0.298412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2333  dihydrouridine synthase, DuS  32.04 
 
 
315 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.108163  normal  0.0297059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2504  tRNA-dihydrouridine synthase C  35.67 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2859  dihydrouridine synthase, DuS  32.37 
 
 
308 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.748261  hitchhiker  0.0000000322781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4401  nifR3 family TIM-barrel protein  33.53 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2788  TIM-barrel protein, nifR3 family  32.02 
 
 
325 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00335838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2413  tRNA-dihydrouridine synthase C  32.95 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1464  nifR3 family TIM-barrel protein  33.9 
 
 
362 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00679382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0110  nifR3 family TIM-barrel protein  31.61 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000348489  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2697  dihydrouridine synthase DuS  32.22 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0155722  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2884  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein NifR3  33.14 
 
 
354 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.423298  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2236  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  28.36 
 
 
347 aa  82  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64486  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2287  tRNA-dihydrouridine synthase C  35.03 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3045  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.75 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2561  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  31.22 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000534823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2727  dihydrouridine synthase, DuS  31.18 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165844  normal  0.161387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1835  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  33.54 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0030  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  31.38 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>