More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3407 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3407  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 367 aa  720    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2200  protein phosphatase 2C-like  75.68 
 
 		 368 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1358  protein serine/threonine phosphatase  56.9 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2529  protein serine/threonine phosphatase  56.2 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7317  serine phosphatase  53.89 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1597  serine phosphatase  49.42 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0929123  normal  0.95677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3481  stage II sporulation E family protein  45.58 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7303  protein serine/threonine phosphatase  41.39 
 
 		 435 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.0111745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1377  protein serine/threonine phosphatase  42.36 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3520  Stage II sporulation E family protein  42.01 
 
 		 357 aa  192  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.67 
 
 		 997 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.9 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  26.81 
 
 		 705 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  34.45 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  29.44 
 
 		 754 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  31.25 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  32.64 
 
 		 649 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  32.89 
 
 		 502 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  34.2 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  37.09 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  31.67 
 
 		 781 aa  70.5  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  29.26 
 
 		 612 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.05 
 
 		 1087 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  32.02 
 
 		 649 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  31.6 
 
 		 846 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  31.28 
 
 		 642 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  31.22 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.79 
 
 		 748 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.3 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  30.17 
 
 		 1087 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  34.53 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  30 
 
 		 684 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.11 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  34.15 
 
 		 716 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  33.7 
 
 		 755 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3489  putative PAS/PAC sensor protein  27 
 
 		 636 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  31.58 
 
 		 705 aa  67  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  30.32 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  30.36 
 
 		 885 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.2 
 
 		 523 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.7 
 
 		 995 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  28.92 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  29.75 
 
 		 676 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.68 
 
 		 1051 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  33.99 
 
 		 1017 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  26.8 
 
 		 1079 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.18 
 
 		 692 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  31.76 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  30.3 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  29.61 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  29.12 
 
 		 642 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  28.76 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.71 
 
 		 702 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  29.58 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  30.05 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  30.3 
 
 		 574 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  32.02 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  26.36 
 
 		 465 aa  62.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  28.92 
 
 		 708 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  32.63 
 
 		 853 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  30.8 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.04 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  35.22 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  28.09 
 
 		 1100 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.91 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  30.95 
 
 		 643 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.57 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  27.54 
 
 		 637 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0195  sigma factor sigB regulation protein  28.37 
 
 		 683 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  33.07 
 
 		 645 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.72 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  30.68 
 
 		 709 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  26.37 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  28.5 
 
 		 648 aa  59.7  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.26 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  29.69 
 
 		 706 aa  59.7  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  26.58 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  35.77 
 
 		 770 aa  59.7  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  33.48 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.14 
 
 		 560 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.02 
 
 		 1004 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  27.78 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.34 
 
 		 1017 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  25.13 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  38.95 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  29.68 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.12 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.89 
 
 		 847 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3900  serine phosphatase  29.71 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3915  stage II sporulation E family protein  29.71 
 
 		 661 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.688937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  30.26 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  29.01 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3974  stage II sporulation E family protein  29.71 
 
 		 661 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.63 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 1711 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  29.47 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  29.11 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>