More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3520 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3520  Stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 357 aa  669    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1358  protein serine/threonine phosphatase  47.31 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1597  serine phosphatase  46.42 
 
 		 374 aa  249  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0929123  normal  0.95677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2200  protein phosphatase 2C-like  43.08 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7317  serine phosphatase  41.79 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3481  stage II sporulation E family protein  41.34 
 
 		 367 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7303  protein serine/threonine phosphatase  38.21 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.0111745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2529  protein serine/threonine phosphatase  45.58 
 
 		 368 aa  209  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1377  protein serine/threonine phosphatase  48.53 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3407  protein serine/threonine phosphatase  41.95 
 
 		 367 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.9 
 
 		 563 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  36 
 
 		 1051 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  37.43 
 
 		 781 aa  73.6  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  33.51 
 
 		 705 aa  73.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  34.3 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  39.02 
 
 		 688 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  36.04 
 
 		 570 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3489  putative PAS/PAC sensor protein  29.73 
 
 		 636 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  34.09 
 
 		 760 aa  67  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  43.59 
 
 		 502 aa  66.2  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  36.65 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  34.2 
 
 		 634 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  34.52 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.23 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.85 
 
 		 997 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0436  Stage II sporulation E family protein  38.3 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.8 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  29 
 
 		 697 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  29.84 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  38.24 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1390 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1390 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1390 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  37.42 
 
 		 649 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  32.68 
 
 		 846 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.85 
 
 		 678 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.7 
 
 		 672 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.42 
 
 		 566 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.27 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.63 
 
 		 602 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.42 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  31.63 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.61 
 
 		 748 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.27 
 
 		 702 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.72 
 
 		 738 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  33.15 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  31.35 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  27.14 
 
 		 706 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  29.23 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.22 
 
 		 847 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  25.58 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  36.64 
 
 		 828 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  33.7 
 
 		 851 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.42 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  28.38 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.3 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 377 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  37.33 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  40.51 
 
 		 643 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.85 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  29.79 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.59 
 
 		 684 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  40.51 
 
 		 657 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  29.07 
 
 		 642 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  32.2 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.47 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  41.86 
 
 		 676 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  34.81 
 
 		 645 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  30.98 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.33 
 
 		 1045 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  30.85 
 
 		 451 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.28 
 
 		 995 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  28.51 
 
 		 716 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.02 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  42.86 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.85 
 
 		 692 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  32.67 
 
 		 713 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  28.99 
 
 		 693 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  34.78 
 
 		 1087 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 1248 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.79 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  28.34 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  31.91 
 
 		 671 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  31.03 
 
 		 755 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.18 
 
 		 572 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  32.37 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  31.33 
 
 		 502 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  28.36 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  29.69 
 
 		 438 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  35.71 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  33.51 
 
 		 260 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  30.77 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  33.15 
 
 		 519 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  30.34 
 
 		 644 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.25 
 
 		 728 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  29.65 
 
 		 467 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>