199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3481 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3481  stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 367 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1597  serine phosphatase  50 
 
 		 374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0929123  normal  0.95677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2200  protein phosphatase 2C-like  48.26 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1358  protein serine/threonine phosphatase  46 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3407  protein serine/threonine phosphatase  46.94 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7303  protein serine/threonine phosphatase  40.92 
 
 		 435 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.0111745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7317  serine phosphatase  51.43 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2529  protein serine/threonine phosphatase  49.24 
 
 		 368 aa  225  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1377  protein serine/threonine phosphatase  50.57 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3520  Stage II sporulation E family protein  44.27 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  34.6 
 
 		 1017 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  32.45 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  35.32 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0195  sigma factor sigB regulation protein  29.05 
 
 		 683 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0140  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  31.77 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2012  Stage II sporulation E family protein  32.54 
 
 		 612 aa  63.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  37.68 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  38.93 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  33.56 
 
 		 648 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  36.05 
 
 		 676 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  30.88 
 
 		 657 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  29.69 
 
 		 705 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.78 
 
 		 995 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  30.88 
 
 		 643 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.25 
 
 		 590 aa  59.7  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.39 
 
 		 830 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.05 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.27 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.29 
 
 		 566 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  34.04 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  34.25 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  28.95 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.65 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  30.72 
 
 		 560 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  35.42 
 
 		 716 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.9 
 
 		 692 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  36.28 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  34.07 
 
 		 645 aa  57  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  31.89 
 
 		 708 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 781 aa  56.6  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  30.69 
 
 		 642 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.3 
 
 		 672 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.5 
 
 		 688 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.07 
 
 		 394 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  27.52 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.68 
 
 		 525 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  32.54 
 
 		 543 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.06 
 
 		 602 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  32.05 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.5 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  28.92 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.23 
 
 		 997 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  28.57 
 
 		 688 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  32.93 
 
 		 660 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  33.08 
 
 		 713 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  33.75 
 
 		 653 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  34.55 
 
 		 545 aa  53.9  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.2 
 
 		 465 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  30.2 
 
 		 465 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1021  putative PAS/PAC sensor protein  32.47 
 
 		 564 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.45 
 
 		 447 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 688 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41 
 
 		 438 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  46.05 
 
 		 406 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  28.14 
 
 		 543 aa  52.8  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  30.64 
 
 		 418 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.03 
 
 		 748 aa  52.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  31.62 
 
 		 705 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  35.42 
 
 		 644 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  29.44 
 
 		 755 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  24.5 
 
 		 754 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  30.14 
 
 		 631 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  27.09 
 
 		 459 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  33.13 
 
 		 738 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  39.47 
 
 		 502 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  28.37 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.86 
 
 		 1051 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  28.65 
 
 		 670 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  34.55 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  34.04 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.88 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  30.77 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3489  putative PAS/PAC sensor protein  27.18 
 
 		 636 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  28.89 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  31.01 
 
 		 708 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  29.45 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.59 
 
 		 467 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  25.6 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.77 
 
 		 447 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  28.95 
 
 		 451 aa  49.7  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  27.13 
 
 		 612 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3351  stage II sporulation E family protein  30.64 
 
 		 278 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  29.59 
 
 		 723 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>