More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2012 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2012  Stage II sporulation E family protein  100 
 
 
612 aa  1169    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.6 
 
 
763 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2444  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.47 
 
 
683 aa  111  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  37.91 
 
 
757 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  35.43 
 
 
562 aa  95.1  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  35.39 
 
 
574 aa  92.8  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1383 aa  91.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.44 
 
 
650 aa  90.9  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.579534  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.63 
 
 
692 aa  90.5  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  35.8 
 
 
546 aa  88.6  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
1248 aa  86.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
1385 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1777  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.07 
 
 
621 aa  86.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  34.7 
 
 
591 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  35.58 
 
 
660 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.96 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  34.7 
 
 
393 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  34.7 
 
 
393 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.28 
 
 
438 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  34.7 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  31.51 
 
 
427 aa  83.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  35.74 
 
 
1225 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  34.43 
 
 
797 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  37.09 
 
 
1432 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.97 
 
 
1051 aa  81.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  31.21 
 
 
618 aa  80.5  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  34.72 
 
 
643 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  35.87 
 
 
693 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  31 
 
 
721 aa  79.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  34.72 
 
 
594 aa  78.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  32.5 
 
 
851 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.15 
 
 
847 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  32.02 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.63 
 
 
688 aa  77.4  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  28.23 
 
 
637 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.45 
 
 
371 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  29.23 
 
 
585 aa  76.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.15 
 
 
678 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  31.84 
 
 
700 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  32.77 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.52 
 
 
738 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  33.06 
 
 
828 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8460  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.91 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  30.49 
 
 
572 aa  75.1  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  27.27 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2290  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.65 
 
 
603 aa  74.7  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.400791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.5 
 
 
616 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  28.83 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.84 
 
 
750 aa  74.3  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
1361 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  31.65 
 
 
543 aa  73.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2748  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.31 
 
 
399 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  31.55 
 
 
772 aa  73.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  30.63 
 
 
692 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.19 
 
 
697 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  32.26 
 
 
713 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  25.66 
 
 
705 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  31.33 
 
 
723 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.77 
 
 
602 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  34.6 
 
 
694 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  28.3 
 
 
776 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.48 
 
 
1045 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  29.32 
 
 
397 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.68 
 
 
549 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  28.74 
 
 
648 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  33.66 
 
 
723 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.78 
 
 
553 aa  71.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.92 
 
 
817 aa  70.9  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  33.98 
 
 
800 aa  70.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.29 
 
 
579 aa  71.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.47 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  34.6 
 
 
693 aa  70.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 
1017 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.57 
 
 
952 aa  70.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  29.1 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  34.71 
 
 
688 aa  70.5  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 
781 aa  70.1  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
1370 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  33.85 
 
 
607 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  38.02 
 
 
544 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.69 
 
 
830 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 
770 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
1711 aa  69.7  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  30.59 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.31 
 
 
532 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  29.77 
 
 
634 aa  69.3  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.63 
 
 
583 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  28.91 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  27.59 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  35.95 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  30.63 
 
 
866 aa  68.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  28.44 
 
 
775 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  33.52 
 
 
563 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1576  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.18 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0296276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5361  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.52 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155785  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  35.15 
 
 
738 aa  67.8  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  30.12 
 
 
697 aa  67.8  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 
760 aa  67.8  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  23.48 
 
 
509 aa  67.8  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 
1390 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>