More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2290 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2290  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
603 aa  1187    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.400791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.63 
 
 
650 aa  566  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.579534  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.32 
 
 
529 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.07 
 
 
867 aa  260  5.0000000000000005e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.19 
 
 
988 aa  259  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.64 
 
 
809 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.052407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.69 
 
 
871 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.115192  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.7 
 
 
775 aa  246  6e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.733388 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0478  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.58 
 
 
859 aa  237  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0447  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
760 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58462  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.39 
 
 
816 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0233266  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.58 
 
 
819 aa  233  6e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3334  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.51 
 
 
887 aa  230  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.01 
 
 
518 aa  229  9e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.901147  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.51 
 
 
1064 aa  226  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.99 
 
 
864 aa  226  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 
931 aa  221  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 
494 aa  220  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2681  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.02 
 
 
767 aa  207  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.470169 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3638  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.18 
 
 
576 aa  207  7e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.33 
 
 
783 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2255  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.19 
 
 
521 aa  204  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.626762 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.03 
 
 
1066 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00761831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.22 
 
 
601 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
592 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.814003  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3145  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 
832 aa  192  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390275  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.51 
 
 
298 aa  186  7e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.141917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 
571 aa  183  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 
753 aa  183  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 
529 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.766916  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 
565 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 
564 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 
553 aa  176  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1681  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.22 
 
 
556 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
833 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0891124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 
571 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.53 
 
 
571 aa  167  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.58 
 
 
660 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.64 
 
 
417 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  33.15 
 
 
660 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  33.15 
 
 
660 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  33.15 
 
 
660 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  33.15 
 
 
660 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  33.15 
 
 
660 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.1 
 
 
588 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.857462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.19 
 
 
566 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00481169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.82 
 
 
588 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.67 
 
 
947 aa  160  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.393804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  31.88 
 
 
660 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.97 
 
 
417 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  31.23 
 
 
660 aa  160  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
675 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 
329 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.240789  normal  0.07707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.14 
 
 
660 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.64 
 
 
526 aa  157  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.35 
 
 
563 aa  156  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  29.97 
 
 
660 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  29.97 
 
 
650 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  31.78 
 
 
660 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  29.97 
 
 
650 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  29.14 
 
 
660 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.58 
 
 
517 aa  154  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1578  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.44 
 
 
663 aa  154  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365209  normal  0.192344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  31.51 
 
 
660 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1024  methyl-accepting chemotaxis protein  28.93 
 
 
575 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1439  methyl-accepting chemotaxis protein  31.44 
 
 
571 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.181327  hitchhiker  0.0000921474 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  29.14 
 
 
660 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1675  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.93 
 
 
572 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1046  methyl-accepting chemotaxis protein  28.65 
 
 
575 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  29.97 
 
 
650 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  29.14 
 
 
660 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1125  methyl-accepting chemotaxis protein  28.65 
 
 
575 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.79 
 
 
695 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.43 
 
 
660 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1028  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.05 
 
 
575 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  30.88 
 
 
689 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3196  methyl-accepting chemotaxis protein  32.87 
 
 
428 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5194  chemotaxis signal transducer  30.64 
 
 
564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5180  methyl-accepting chemotaxis protein  30.64 
 
 
564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000913296  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.17 
 
 
541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.18 
 
 
540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.59 
 
 
664 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4162  methyl-accepting chemotaxis protein  27.48 
 
 
575 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 
553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 
676 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4749  chemotaxis signal transducer  30.35 
 
 
564 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4768  methyl-accepting chemotaxis protein  30.35 
 
 
564 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 
426 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 
713 aa  148  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3031  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.86 
 
 
297 aa  148  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5149  chemotaxis signal transducer  30.35 
 
 
564 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000249122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5185  methyl-accepting chemotaxis protein  30.06 
 
 
564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00149704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3335  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 
430 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1178  methyl-accepting chemotaxis protein  27.76 
 
 
575 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.477554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3774  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.17 
 
 
574 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271484  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0379  methyl-accepting chemotaxis protein  29.56 
 
 
579 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  29.46 
 
 
658 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.83 
 
 
657 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.54 
 
 
441 aa  146  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0065  methyl-accepting chemotaxis protein  29.77 
 
 
564 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00962116  normal  0.0819317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>