231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7303 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7303  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
435 aa  853    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.0111745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1358  protein serine/threonine phosphatase  42.29 
 
 
372 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2200  protein phosphatase 2C-like  40.26 
 
 
368 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3481  stage II sporulation E family protein  43.15 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1597  serine phosphatase  38.62 
 
 
374 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0929123  normal  0.95677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7317  serine phosphatase  38.37 
 
 
371 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2529  protein serine/threonine phosphatase  38.57 
 
 
368 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3407  protein serine/threonine phosphatase  53.12 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389511  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1377  protein serine/threonine phosphatase  40.31 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3520  Stage II sporulation E family protein  37.84 
 
 
357 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40.15 
 
 
692 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  31.52 
 
 
642 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  30.09 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  28.09 
 
 
642 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.05 
 
 
995 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.42 
 
 
384 aa  67  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 
781 aa  66.6  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.2 
 
 
453 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  35.43 
 
 
535 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.54 
 
 
1004 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  27.41 
 
 
612 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  33 
 
 
847 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  31.16 
 
 
705 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  34.1 
 
 
676 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  31.69 
 
 
705 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.94 
 
 
384 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  30.39 
 
 
467 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  31.77 
 
 
309 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  27.75 
 
 
472 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  25.53 
 
 
415 aa  59.7  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  27.98 
 
 
672 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  34.34 
 
 
757 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  38.28 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.04 
 
 
532 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  29.94 
 
 
706 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.07 
 
 
590 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  33.33 
 
 
438 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2012  Stage II sporulation E family protein  30.58 
 
 
612 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  35.63 
 
 
865 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  30.73 
 
 
851 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 
545 aa  57.8  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.72 
 
 
1045 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.76 
 
 
1051 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  27.72 
 
 
576 aa  57  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  32.85 
 
 
649 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  31.09 
 
 
1017 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  34.67 
 
 
708 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  34.27 
 
 
846 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.84 
 
 
572 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  29.53 
 
 
688 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.51 
 
 
830 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  38.35 
 
 
800 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  28.36 
 
 
472 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  30.2 
 
 
543 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1390 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1390 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1390 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3351  stage II sporulation E family protein  28.4 
 
 
278 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0056  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.1 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.97 
 
 
523 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  28.71 
 
 
455 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.67 
 
 
606 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  30.31 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  26.9 
 
 
631 aa  54.3  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.39 
 
 
400 aa  53.9  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  38.16 
 
 
653 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  28.3 
 
 
697 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  27.66 
 
 
391 aa  53.1  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  32.17 
 
 
409 aa  53.5  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  30.89 
 
 
470 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  34.4 
 
 
828 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  33.58 
 
 
451 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  28.26 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.8 
 
 
563 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  31.54 
 
 
465 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  25 
 
 
754 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.53 
 
 
702 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  36.44 
 
 
709 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  31.58 
 
 
644 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.54 
 
 
465 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  34.39 
 
 
738 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.35 
 
 
1017 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  30.27 
 
 
583 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
1711 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.29 
 
 
748 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5852  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.08 
 
 
424 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910285  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  30.15 
 
 
390 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  39.82 
 
 
547 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
1385 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.32 
 
 
447 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0140  response regulator receiver protein  25.74 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  30.1 
 
 
713 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3489  putative PAS/PAC sensor protein  24.4 
 
 
636 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.85 
 
 
941 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.41 
 
 
525 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  36.44 
 
 
760 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.47 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  27.27 
 
 
423 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.2 
 
 
997 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  32.59 
 
 
469 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>