More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2200 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2200  protein phosphatase 2C-like  100 
 
 		 368 aa  720    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3407  protein serine/threonine phosphatase  75.68 
 
 		 367 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1358  protein serine/threonine phosphatase  57.47 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7317  serine phosphatase  53.03 
 
 		 371 aa  335  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2529  protein serine/threonine phosphatase  52.91 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1597  serine phosphatase  48.7 
 
 		 374 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0929123  normal  0.95677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3481  stage II sporulation E family protein  46.05 
 
 		 367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7303  protein serine/threonine phosphatase  40.26 
 
 		 435 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.0111745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3520  Stage II sporulation E family protein  42.17 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1377  protein serine/threonine phosphatase  43.5 
 
 		 382 aa  189  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.34 
 
 		 563 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  34.14 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  33.18 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.26 
 
 		 997 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  29.58 
 
 		 754 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 642 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3489  putative PAS/PAC sensor protein  30.92 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.08 
 
 		 1051 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  33.99 
 
 		 1017 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 1711 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  30.73 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  38.12 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  37.8 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.84 
 
 		 523 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  32.81 
 
 		 755 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  30.85 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  30.69 
 
 		 846 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  28.14 
 
 		 642 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  25.53 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.47 
 
 		 702 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.82 
 
 		 748 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  30.11 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  28.43 
 
 		 708 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  30.39 
 
 		 684 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  32.88 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.75 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  28.82 
 
 		 705 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  29.73 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  33.33 
 
 		 645 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  27.61 
 
 		 1079 aa  63.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.56 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  28.87 
 
 		 1100 aa  62.8  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  35.33 
 
 		 716 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  31.46 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.77 
 
 		 692 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  34 
 
 		 705 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.43 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  29.79 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  32.53 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  29.52 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.49 
 
 		 995 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  32.75 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 781 aa  61.2  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0140  response regulator receiver protein  28.05 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  30.56 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  27.81 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  28.91 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  35.76 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  29.47 
 
 		 612 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  27.24 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.81 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2012  Stage II sporulation E family protein  30.68 
 
 		 612 aa  60.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0964  stage II sporulation E  29.41 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.104337  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  30.13 
 
 		 560 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  30 
 
 		 1087 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  24.35 
 
 		 637 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  32.41 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.9 
 
 		 560 aa  59.7  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  28.5 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  28.48 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  30.56 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 1248 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  29.28 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  32.02 
 
 		 853 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  31.07 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0436  Stage II sporulation E family protein  34.42 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0392  serine phosphatase  30.25 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0288764  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3986  serine phosphatase  33.07 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  30.54 
 
 		 713 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.16 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.23 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  29.94 
 
 		 648 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.14 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  30.86 
 
 		 426 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0195  sigma factor sigB regulation protein  28.04 
 
 		 683 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.67 
 
 		 486 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  33.78 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  29 
 
 		 1087 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 		 693 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  30.51 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  29.1 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  33.73 
 
 		 643 aa  56.6  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.36 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  28.82 
 
 		 1083 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 1385 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  31.38 
 
 		 1082 aa  56.2  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>