139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1051 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1051  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 792 aa  1548    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0760  transcriptional regulator, SARP family  55.12 
 
 		 800 aa  729    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0281555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0797  SARP family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 565 aa  159  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal  0.265845 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3442  hypothetical protein  38.8 
 
 		 562 aa  145  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.175403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3205  hypothetical protein  38.8 
 
 		 562 aa  145  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000812064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.43 
 
 		 782 aa  84.7  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.26 
 
 		 991 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 		 1186 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.58 
 
 		 2145 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1060 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  29.22 
 
 		 755 aa  65.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  28.19 
 
 		 775 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 1101 aa  62  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.4 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 		 985 aa  61.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 		 1063 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 		 1162 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 1313 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.2 
 
 		 609 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 612 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 637 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 636 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 1298 aa  57.8  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1162 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.28 
 
 		 626 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.01 
 
 		 568 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 949 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.28 
 
 		 614 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.28 
 
 		 614 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 614 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 1025 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 568 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 878 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.28 
 
 		 626 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.84 
 
 		 1507 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  33.54 
 
 		 1004 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1261 aa  55.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.57 
 
 		 1279 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 614 aa  55.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 408 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 		 1288 aa  54.7  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  25.79 
 
 		 807 aa  54.7  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  21.83 
 
 		 725 aa  54.3  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 		 852 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  21.86 
 
 		 1266 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 760 aa  53.9  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 758 aa  53.5  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 639 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  29.86 
 
 		 913 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  24.88 
 
 		 689 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 635 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 635 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 843 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 611 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 620 aa  52  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1550 aa  52  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.03 
 
 		 714 aa  51.6  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.78 
 
 		 340 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.79 
 
 		 1056 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 534 aa  51.2  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.76 
 
 		 1238 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 		 900 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  25.5 
 
 		 311 aa  50.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.49 
 
 		 957 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1215 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.07 
 
 		 816 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 1048 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.64 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  32.75 
 
 		 456 aa  50.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 602 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  25.47 
 
 		 825 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0345  SARP family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 837 aa  50.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  23.36 
 
 		 620 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  29.93 
 
 		 1022 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  28.7 
 
 		 1033 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 343 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  25.82 
 
 		 822 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  28.47 
 
 		 299 aa  49.3  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 1024 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  26.49 
 
 		 965 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.8 
 
 		 636 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 614 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3806  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 600 aa  48.9  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0299153 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1404 aa  48.9  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.74 
 
 		 1131 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 562 aa  48.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 203 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1827 aa  48.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  26.96 
 
 		 672 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 751 aa  47.8  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 718 aa  47.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 767 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 1526 aa  47.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.35 
 
 		 1468 aa  47.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  31.25 
 
 		 1143 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  25.81 
 
 		 783 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 750 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  25.32 
 
 		 919 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  25 
 
 		 364 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1596 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>