201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0797 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3205  hypothetical protein  76.33 
 
 		 562 aa  730    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000812064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0797  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 565 aa  1081    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal  0.265845 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3442  hypothetical protein  76.33 
 
 		 562 aa  730    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.175403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0760  transcriptional regulator, SARP family  45.11 
 
 		 800 aa  223  7e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0281555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1051  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 		 792 aa  158  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.04 
 
 		 810 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 		 1288 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 878 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.09 
 
 		 782 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  33.86 
 
 		 672 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.52 
 
 		 714 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.93 
 
 		 1131 aa  61.6  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 573 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  28.19 
 
 		 1180 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  34.72 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1238 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.9 
 
 		 1979 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 		 1105 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 542 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 1215 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.66 
 
 		 767 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.27 
 
 		 2145 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 505 aa  55.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 632 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0583  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 		 1333 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204849  normal  0.7877 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 568 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.29 
 
 		 957 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.26 
 
 		 568 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.06 
 
 		 1186 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 1276 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  25.82 
 
 		 514 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.62 
 
 		 875 aa  54.3  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 659 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 543 aa  54.3  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 646 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.03 
 
 		 416 aa  53.9  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 924 aa  53.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  29.95 
 
 		 1507 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 750 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  35.62 
 
 		 996 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 955 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  27.33 
 
 		 1266 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 467 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 4079 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.85 
 
 		 1328 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 809 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 927 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 465 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 935 aa  52  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  40.2 
 
 		 968 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.82 
 
 		 1009 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  25.55 
 
 		 822 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 		 919 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.03 
 
 		 609 aa  51.6  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 621 aa  51.2  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 771 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 910 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  29.63 
 
 		 844 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  31.44 
 
 		 680 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 649 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.72 
 
 		 725 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  34.59 
 
 		 202 aa  50.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.43 
 
 		 732 aa  50.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 		 854 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 804 aa  50.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1590  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 294 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  32.68 
 
 		 910 aa  50.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.66 
 
 		 991 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.01 
 
 		 587 aa  50.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.95 
 
 		 560 aa  50.4  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  32.35 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 217 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 685 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.31 
 
 		 1007 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.4 
 
 		 330 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 1025 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  41.58 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 768 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 740 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 481 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1261 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  30.72 
 
 		 994 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1069 aa  49.7  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 		 1252 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  33.33 
 
 		 340 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 443 aa  48.5  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 		 1252 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 243 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1818  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 229 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.37 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 3035 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1060 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 700 aa  47.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>