167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3442 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0797  SARP family transcriptional regulator  76.33 
 
 		 565 aa  745    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal  0.265845 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3205  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1056    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000812064 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3442  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1056    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.175403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0760  transcriptional regulator, SARP family  44.36 
 
 		 800 aa  233  9e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0281555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1051  TPR repeat-containing protein  38.8 
 
 		 792 aa  173  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.51 
 
 		 1288 aa  67  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  31.94 
 
 		 672 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1238 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.4 
 
 		 2145 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.89 
 
 		 767 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 924 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 955 aa  60.8  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 1105 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.98 
 
 		 810 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  27.98 
 
 		 1131 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.12 
 
 		 714 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 		 754 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  27.46 
 
 		 822 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.61 
 
 		 1022 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  28.19 
 
 		 1180 aa  57  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  29.26 
 
 		 725 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 878 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1550 aa  56.2  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 1215 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.06 
 
 		 565 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 		 754 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 935 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  28.43 
 
 		 1507 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 787 aa  55.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.8 
 
 		 782 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  31 
 
 		 919 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.02 
 
 		 1186 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1276 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.42 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 542 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.1 
 
 		 991 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  31.28 
 
 		 1328 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  31.08 
 
 		 648 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 1285 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.52 
 
 		 609 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 543 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 568 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  29.58 
 
 		 311 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.84 
 
 		 568 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 1261 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 751 aa  51.6  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 467 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 503 aa  51.6  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 3145 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.44 
 
 		 957 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 649 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.18 
 
 		 1694 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  31.44 
 
 		 680 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.44 
 
 		 771 aa  50.8  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 659 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.37 
 
 		 623 aa  50.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 910 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 714 aa  50.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1039 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.1 
 
 		 1007 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  26.81 
 
 		 844 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 3035 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  30.13 
 
 		 1054 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.38 
 
 		 632 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  24.57 
 
 		 635 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 649 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 649 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.2 
 
 		 1424 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 1060 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0583  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 1333 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204849  normal  0.7877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.35 
 
 		 1000 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  37.37 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 740 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.36 
 
 		 885 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.42 
 
 		 1266 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 		 494 aa  48.9  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  23.31 
 
 		 1056 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1069 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 843 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1818  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 229 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3457  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 714 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 646 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 481 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.44 
 
 		 560 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.38 
 
 		 1468 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 750 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 		 586 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 574 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 814 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 		 472 aa  47.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.14 
 
 		 416 aa  47.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 1025 aa  47.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.09 
 
 		 603 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1049 aa  47.4  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.41 
 
 		 560 aa  47  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>