292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0268 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  100 
 
 		 321 aa  616  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  58.39 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  35.33 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  35.83 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  34.5 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  35.83 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  35.19 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  32.11 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  34.38 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  34.38 
 
 		 342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  33.93 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  31.35 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  33.66 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  31.15 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  34.84 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  31.15 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  31.01 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  28.48 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  31.02 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  30.32 
 
 		 315 aa  99.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.68 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30.49 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  29.33 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  29.33 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.88 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  29.15 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  29.19 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  32.62 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  32.08 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  32.26 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  30.49 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  31.17 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  31.77 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  30.84 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.01 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  30.94 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  29.28 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  29.28 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  28.35 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  30.16 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  29.18 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  26.73 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  31.23 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  31.93 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  28.2 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  32.48 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.29 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  31.33 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28.13 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.91 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  28.13 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  27.19 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  30.46 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  27.19 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  29.97 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  27.94 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  27.42 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  30.03 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.73 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  30.77 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  32.43 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  31.49 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  27.99 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  30.66 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  27.99 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29.24 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  28.81 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.22 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  31.78 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  25.73 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  29.11 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.96 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  30.34 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  26.53 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  30.56 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  28.8 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.44 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  28.99 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.03 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  26.44 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  27.03 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  25.76 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  28.88 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.99 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  24.1 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  31.21 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>