215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2059 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  99.71 
 
 		 342 aa  665    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  100 
 
 		 342 aa  667    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  70.4 
 
 		 322 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  68.1 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  57.09 
 
 		 315 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  54.93 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  53.35 
 
 		 316 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  33.44 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  29.97 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  29.55 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  29.55 
 
 		 318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  36.84 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.99 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.71 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.71 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  28.3 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  31.58 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.97 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.22 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  31.95 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  32.25 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  30.35 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 309 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.48 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  27.76 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  25.89 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  28.75 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.73 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.44 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.99 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  28.17 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  27.41 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  30.51 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  28.92 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  21.24 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  23.4 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.77 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  28.09 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  24.38 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  26.77 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  28.3 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  26.69 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  30.03 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  28.31 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  24.84 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  27.48 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  26.76 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.39 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  27.09 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.31 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  27.09 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  25.24 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  24.57 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  24.77 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  25.77 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  28.22 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  29.13 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  25.93 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  21.43 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25.31 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.53 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  22.81 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  27.08 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  23.91 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  32.64 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  27.9 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  23.6 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  23.6 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  26.73 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  24.66 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  24.38 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  28.66 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  31.03 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  26.27 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  22.05 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>