260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1105 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  100 
 
 		 320 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  99.69 
 
 		 320 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  97.5 
 
 		 320 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  91.56 
 
 		 319 aa  584  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  85.62 
 
 		 320 aa  552  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  85.62 
 
 		 320 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  85.62 
 
 		 320 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  85 
 
 		 320 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  85.31 
 
 		 320 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  64.47 
 
 		 322 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  57.85 
 
 		 332 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  60.57 
 
 		 322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  57.23 
 
 		 325 aa  339  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  52.83 
 
 		 322 aa  265  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  48.33 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  33.23 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  33.01 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  32.93 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  29 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  29.75 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.17 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.5 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  29.47 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.42 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  28.66 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  27.85 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.53 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.91 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  27.45 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  27.61 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  29.1 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.1 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  28.89 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  27.69 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  29.38 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  29.01 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.4 
 
 		 315 aa  92.4  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 309 aa  92.8  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.17 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  29.61 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  27.16 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  28.14 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  27.16 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.72 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  25.94 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.72 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  26.45 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  28.99 
 
 		 361 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 		 309 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  26.27 
 
 		 319 aa  85.9  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.13 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  26.61 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  23.55 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  22.26 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  24.17 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  21.94 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  24.14 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  25.57 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  26.77 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  23.43 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  23.84 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  26.3 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.21 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  26.14 
 
 		 315 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  26.04 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  28.35 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  29.37 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3529  auxin efflux carrier  25.8 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  25.34 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  29.66 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  22.04 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  25.71 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  25.47 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  24.05 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  26.52 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  24.92 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  20.78 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  21.41 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  21.41 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  21.41 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  25.74 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>