205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3161 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 309 aa  597  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  95.79 
 
 		 309 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  95.47 
 
 		 309 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  70.45 
 
 		 325 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  49.35 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  35.56 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  34.29 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  35.87 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  38.31 
 
 		 311 aa  178  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  35.02 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  32.9 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  34.56 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  32.12 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  30.87 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  30.87 
 
 		 312 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  30.23 
 
 		 312 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  32.17 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  29.8 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.54 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  30.41 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.51 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  28.53 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  29.77 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  30.74 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  29.13 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.69 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.47 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  27.51 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.47 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.8 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.6 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.71 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.87 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  31.85 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.98 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 372 aa  89.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  30.41 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  30.49 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25.32 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  30.56 
 
 		 367 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.81 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  27.48 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  24.53 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  23.1 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  26.58 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  29.33 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  23.93 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  27.95 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  23.93 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.93 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  23.93 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.16 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  26.52 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  30.59 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  22.3 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  28.74 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.85 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  28.33 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  24.61 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  29.21 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  30.33 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  25 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  28.76 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.01 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.64 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  26.47 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  30.34 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  26.96 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  26.02 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  26.03 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  23.13 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  28.34 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  25.22 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>