288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4406 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 315 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  96.19 
 
 		 315 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  68.57 
 
 		 315 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  66.13 
 
 		 314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  40.45 
 
 		 324 aa  228  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  37.46 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  35.87 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  35.87 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  35.87 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  34.92 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  32.58 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  32.26 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  32.36 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  31.33 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  33.12 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  32.35 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  30.97 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  29.41 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  30.57 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  29.93 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  33.12 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.93 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  30.28 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.49 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  27.9 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  30.1 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  32.36 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  28.7 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.33 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  27.81 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  31.23 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  27.59 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  30.7 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.95 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  27.97 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  26.95 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.15 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  29.3 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  31.17 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  26.73 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  30.38 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.16 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  25.66 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  26.77 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  24.43 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.59 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  25.3 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  27.88 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.8 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  31.16 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  26.4 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  26.38 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  28.66 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.72 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  27.51 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.41 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  25.9 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  27.99 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  26.27 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  26.03 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.52 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  24.85 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  27.54 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.17 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  27.85 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.17 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  25.17 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25.71 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  27.48 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  26.78 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  23.99 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  25.66 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  25.73 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  27.74 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  25.73 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  25.73 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  26.17 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  25.73 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>