202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3009 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 319 aa  631  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  89.03 
 
 		 319 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  69.28 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  67.4 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  68.97 
 
 		 318 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  68.97 
 
 		 318 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  40.58 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  43.04 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  38.92 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  38.61 
 
 		 318 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  38.61 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  38.61 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  40.38 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  39.24 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  37.94 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  38.92 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  38.61 
 
 		 318 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  38.61 
 
 		 318 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  37.97 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  37.22 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  42.03 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  43.35 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  36.68 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  40.32 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  40.45 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  42.41 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  44 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  38.56 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  39.67 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  38.56 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  38.56 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  38.16 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  38.24 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  38.28 
 
 		 313 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  37.38 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  36.13 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  36.45 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  34.33 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  35.1 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  30.06 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  32.28 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  31.16 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  30.3 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  31.14 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  36.41 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  30.77 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  28.06 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  28.32 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  32.33 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  27.96 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  24.57 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  28.24 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  32.37 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  32.63 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  32.63 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  24.14 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  28.87 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  27.05 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  27.05 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  27.12 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  30.34 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  28.23 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  30.34 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.85 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.91 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  32.21 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  29.66 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.7 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.85 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  26.06 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  27.46 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  29.62 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  24.41 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  28.19 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.18 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.26 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.26 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  27.11 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.26 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.27 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.09 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  29.18 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  28.32 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  27.52 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  30.29 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  22.03 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.68 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  24.34 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  25.57 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>