193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4317 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  100 
 
 		 336 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  100 
 
 		 336 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  91.74 
 
 		 339 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  88.99 
 
 		 336 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  92.26 
 
 		 310 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  69.82 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  60.07 
 
 		 309 aa  340  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  63.76 
 
 		 310 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  56 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  56.63 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  61.18 
 
 		 273 aa  272  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  56.94 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  55.67 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  48.24 
 
 		 304 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  43.28 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  44.7 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  41.5 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  40.33 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  43.85 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  42.05 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  39.4 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  37.09 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  36.52 
 
 		 303 aa  179  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  36.27 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  43.42 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  39.31 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  39.81 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  40.47 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  30.46 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  35.67 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  34.38 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  41.58 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  36.36 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  41.96 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  40.2 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  34.27 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  31.94 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  35.05 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  34.92 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  37.72 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  34.41 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  29.08 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  32.21 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  31.04 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  30.63 
 
 		 330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  30.63 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  29.79 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  30.41 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  29.79 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  31.48 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  31.65 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  32.88 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  31.54 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  30.56 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  33.45 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  31.16 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  30 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  30.45 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  31.16 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  30.1 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  31.51 
 
 		 316 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  32.42 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  32.42 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  28.87 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  28.07 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  31.14 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  28 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  29.18 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  27.95 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  22.68 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  27.87 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  29.69 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  32.09 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  34.01 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  29.45 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  31.37 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  29.82 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  28.37 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  30.85 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  30.21 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  31.29 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  28.98 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  26.39 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  30.39 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  25.34 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  28.28 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.35 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  26.04 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>