186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3536 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  100 
 
 
315 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  35.88 
 
 
302 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  37.58 
 
 
305 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  36.36 
 
 
308 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  34.72 
 
 
303 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  37.25 
 
 
305 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  35.6 
 
 
306 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  34 
 
 
309 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  34.65 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  36.03 
 
 
314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  35.64 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  31.44 
 
 
306 aa  144  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  33.77 
 
 
303 aa  142  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  34.64 
 
 
304 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  36.79 
 
 
301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  32.46 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  34.1 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  34.19 
 
 
308 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  35.64 
 
 
304 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  33.56 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  32.78 
 
 
311 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  33.01 
 
 
299 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  33.22 
 
 
308 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  29.45 
 
 
310 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  32.87 
 
 
315 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  34.71 
 
 
350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  35.62 
 
 
300 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  31.61 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  32.34 
 
 
304 aa  119  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  32.18 
 
 
336 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  32.87 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  31.44 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  31.83 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  33.02 
 
 
297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  31.71 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  28.77 
 
 
339 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  31.14 
 
 
336 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  31.14 
 
 
336 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  33.46 
 
 
273 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  29.21 
 
 
318 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  31.53 
 
 
315 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  29.84 
 
 
307 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  31.51 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  28.12 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  28.43 
 
 
318 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  27.53 
 
 
318 aa  95.9  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  28.43 
 
 
318 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  28.12 
 
 
318 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  32.7 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  28.43 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  32.99 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  27.48 
 
 
318 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  29.39 
 
 
362 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  27.81 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  27.81 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  28.85 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  26.64 
 
 
316 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  30.67 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  25.95 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  27.92 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  27.13 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  27.83 
 
 
313 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  28.17 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  28.34 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  26.44 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  27.51 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  31.27 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  26.47 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  27.51 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  27.36 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  28.01 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  27.83 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  26.9 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  25.47 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  27.51 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.78 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  25.79 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  28.07 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  27.21 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.2 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  29.71 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  23.78 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  29.57 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  28.8 
 
 
372 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  27.8 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  26.69 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  27.8 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  26.61 
 
 
317 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.31 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  23.13 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  27.56 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.38 
 
 
315 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.94 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  26.12 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  26.12 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  27.5 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>