218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4170 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  100 
 
 		 316 aa  620  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  95.53 
 
 		 316 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  81.47 
 
 		 313 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  72.47 
 
 		 315 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  72.52 
 
 		 313 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  72.52 
 
 		 313 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  72.52 
 
 		 313 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  65.81 
 
 		 313 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  66.77 
 
 		 313 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  54.63 
 
 		 315 aa  338  7e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  54.98 
 
 		 316 aa  322  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  40.89 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  43.13 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  41.31 
 
 		 318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  41.67 
 
 		 318 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  38.85 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  41.69 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  39.31 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  40.63 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  41.18 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  42.07 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  40.66 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  40.52 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  38.16 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  40.52 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  40.2 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  37.05 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  40.58 
 
 		 318 aa  195  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  38.24 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  39.74 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  35.57 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  38.28 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  38.28 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  38.61 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  38.11 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  33.97 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  35.35 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  34.81 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  36.21 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  34.56 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  36.91 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  31.25 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  30.54 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  30.72 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  32.23 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 339 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  30.96 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  30.96 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  30.96 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  29.7 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  29.01 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  30 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  30 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  29.23 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  29.84 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  27.46 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  27.89 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  30.14 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  30.1 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.25 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.25 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  30.59 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  28.23 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  30.03 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  29.82 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  29.04 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 362 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  30.05 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  28.18 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  29.66 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  26.22 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  23.86 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  27.99 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  29.18 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  28.68 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  23.86 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  30.18 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  24.18 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  25.66 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  23.92 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  27.93 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  23.97 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  27.49 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  23.63 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.47 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.29 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>