215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5119 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  100 
 
 		 362 aa  704    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  67.67 
 
 		 317 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  68.32 
 
 		 330 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  64.78 
 
 		 301 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  64.45 
 
 		 305 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  64.12 
 
 		 305 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  61.3 
 
 		 332 aa  352  5e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  65.89 
 
 		 305 aa  352  7e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  67.11 
 
 		 301 aa  345  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  52.11 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  48.57 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  40.6 
 
 		 350 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  41.47 
 
 		 312 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  39.12 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  33.67 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  35.43 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  35.43 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  36.99 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  34.95 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  35 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  32.57 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 336 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  34.05 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  32.25 
 
 		 305 aa  122  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  31.41 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  34.41 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  31.51 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  31.85 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  29.76 
 
 		 310 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  32.66 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  30.36 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  33.69 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  32.46 
 
 		 308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  32.43 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  30.58 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  30.58 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  31.67 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  29.32 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  32.01 
 
 		 306 aa  109  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  30.42 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  25.26 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  29.7 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  31.42 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  31.89 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  29.21 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  33.45 
 
 		 304 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  28.52 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  28.22 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  31.58 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.96 
 
 		 314 aa  89.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  30.94 
 
 		 304 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  26.39 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  29.12 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  29.57 
 
 		 313 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.25 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.95 
 
 		 318 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  25.87 
 
 		 318 aa  86.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  26 
 
 		 318 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  26.5 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  26.04 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  26.33 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  26.04 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  29.33 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.38 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  25.91 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  28.75 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  26.58 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  26.96 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  27.03 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  24.08 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  23.49 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.62 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  28.89 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.24 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  25.99 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.05 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  27.46 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  30.45 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  27.64 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.19 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.19 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.19 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>