135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1239 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  100 
 
 		 295 aa  581  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  97.97 
 
 		 319 aa  546  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  66.78 
 
 		 302 aa  358  5e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  40.4 
 
 		 319 aa  228  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  42.41 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  43.62 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  43.29 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  43.29 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  42.95 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  39.46 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  41.08 
 
 		 318 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  40.82 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  41.72 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  43.62 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  43.24 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  43.24 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  43.58 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  39.19 
 
 		 330 aa  199  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  40.4 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  40.4 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  40.4 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  42.47 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  40.07 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  38.44 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  38.8 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  38.6 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  36.03 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  37.04 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  36.58 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  37.54 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  37.54 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  38.13 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  36.88 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  38.13 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  35.57 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  34.56 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  34.22 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  35.97 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  32.74 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  27.65 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  29.22 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  32.08 
 
 		 317 aa  89.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 308 aa  89  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  28.91 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  30.85 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  28.93 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  30.5 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  27.17 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  28.68 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  29.75 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  27.82 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  28.98 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  30.11 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  28.27 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  27.74 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  27.74 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  28.27 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  25.72 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  28.1 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.1 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  24.82 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  27.31 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  32.42 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  28.84 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  27 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  26.47 
 
 		 350 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  28.36 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  28.98 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  28.11 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  26.01 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25.42 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.84 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  23.67 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  27.08 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  28.18 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  23.05 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  26.44 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  28.42 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  27.14 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  25.2 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  25.72 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  24.58 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  25.35 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  27.02 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  22.73 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>