More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3650 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  100 
 
 		 318 aa  622  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  100 
 
 		 318 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  99.37 
 
 		 318 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  76.27 
 
 		 318 aa  498  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  75.63 
 
 		 318 aa  495  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  74.68 
 
 		 318 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  74.37 
 
 		 318 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  33.22 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  30.26 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  29.93 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.77 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  30.98 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  30.79 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29.24 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  31.35 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  29.35 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.99 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  28.24 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28.24 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  31.7 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  32.42 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  28 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  26.73 
 
 		 306 aa  96.3  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  29.37 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 		 309 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  27.63 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  27.1 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  30.55 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  27.5 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  25.83 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29.53 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  26.73 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  27.12 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  26.98 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  28.66 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  28.67 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  25.26 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  25.26 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  24.14 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.01 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  25.95 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.03 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  27.51 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  27.69 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  27.96 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  27.51 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  25.25 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.37 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  26.85 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  25.31 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.11 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  27.09 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  27.44 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  28.33 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  24.08 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  33.97 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.56 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  24.21 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  28.85 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  30.29 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  23.95 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  25.32 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.66 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  27.82 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  25.62 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  24.26 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>