253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1219 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
320 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  98.75 
 
 
320 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  97.5 
 
 
320 aa  620  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  98.12 
 
 
320 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  90.62 
 
 
320 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  86.88 
 
 
320 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  85.62 
 
 
320 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  85.94 
 
 
320 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  82.19 
 
 
319 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  66.25 
 
 
322 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  62.65 
 
 
332 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  62.46 
 
 
322 aa  368  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  60.68 
 
 
325 aa  358  6e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  55.03 
 
 
322 aa  269  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  48 
 
 
315 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  31.95 
 
 
321 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  34.39 
 
 
317 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  32.63 
 
 
337 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  29.67 
 
 
314 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 
314 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.71 
 
 
313 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.38 
 
 
313 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  28.79 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  28.38 
 
 
317 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  30.06 
 
 
372 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  29.74 
 
 
311 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.54 
 
 
311 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  30.1 
 
 
318 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  28.3 
 
 
311 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  27.51 
 
 
311 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  27.6 
 
 
310 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  29.77 
 
 
309 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  24.41 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  27.36 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  30.27 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  27.07 
 
 
319 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  28.7 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  27.85 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.81 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  26.28 
 
 
320 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.08 
 
 
313 aa  92  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.39 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  24.53 
 
 
320 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  28.35 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  26.42 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  26.74 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.38 
 
 
318 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.38 
 
 
318 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  25.16 
 
 
317 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  26.48 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  24.92 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  24.61 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  26.48 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  26.64 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  23.4 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.5 
 
 
309 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  25.17 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  26.43 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  25.82 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  26.14 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  26.23 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  24.76 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  28.98 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  23.93 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  25.99 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.28 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  26.33 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  27.64 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  24.14 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.16 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  25.99 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.34 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  27.38 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  26.37 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  20.9 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  23.51 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  27.54 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  28.34 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  23.86 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  23.18 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  26.8 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  22.71 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  26.77 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  27.62 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  22.86 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  25.16 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.04 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  26.71 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3529  auxin efflux carrier  24.2 
 
 
327 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.97 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  28.11 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  24.1 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  22.67 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  22.71 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  25.16 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>