198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1308 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  100 
 
 
317 aa  619  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  75.33 
 
 
305 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  75.66 
 
 
305 aa  447  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  77.18 
 
 
301 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  73.03 
 
 
330 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  67.67 
 
 
362 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  69.21 
 
 
305 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  68.79 
 
 
332 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  70.13 
 
 
301 aa  359  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  54.93 
 
 
305 aa  275  9e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  51.58 
 
 
300 aa  272  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  43.89 
 
 
350 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  44.94 
 
 
312 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  38.54 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  36.18 
 
 
297 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  33.78 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  34.77 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  32.65 
 
 
311 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  33.11 
 
 
307 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  34.74 
 
 
304 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  34.39 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  31.7 
 
 
308 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  33.44 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  30.64 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  33.33 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.92 
 
 
336 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  29.39 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  37.41 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  34.45 
 
 
305 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  29.21 
 
 
310 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  29.05 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  31.7 
 
 
306 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  35 
 
 
305 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  29.05 
 
 
336 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  29.05 
 
 
336 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  30.9 
 
 
304 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  31.33 
 
 
311 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  34.29 
 
 
315 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  31.15 
 
 
308 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  33.93 
 
 
308 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  33.44 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  33.44 
 
 
315 aa  96.3  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  29.32 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.81 
 
 
307 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  30.58 
 
 
304 aa  92.8  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  25.26 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  29.59 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  30.69 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  27.46 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  32.5 
 
 
310 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.23 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.87 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  28.85 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  26.2 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  26.2 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.9 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  26.13 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  26.21 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  25 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  25.88 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  26.21 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  26.21 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  25.89 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  28.15 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.57 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  29.72 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  30.28 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  26.86 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  26.54 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  25.24 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  27.15 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  27.74 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  25.8 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  25 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  26.3 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  28.2 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  28.98 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  26.19 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  26.12 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  25.09 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  25.09 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  26.04 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  26.71 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.18 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  26.38 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.76 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.76 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.76 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  24.74 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  24.51 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  23.35 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  26.6 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  23.53 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  24.51 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  29 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  27.05 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  23.76 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  25.09 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>