242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2027 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  100 
 
 		 312 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  71.61 
 
 		 310 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  45.87 
 
 		 313 aa  245  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  44.92 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  45.31 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  41.72 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  43.65 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  42.72 
 
 		 317 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  44.18 
 
 		 309 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  42.38 
 
 		 314 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  41.67 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  43.83 
 
 		 372 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  41.55 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  40.77 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  40.89 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  32.38 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  32.12 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  32.05 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30.45 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  31.02 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  31.02 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  30.55 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  30.55 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  30.35 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  32.46 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  31.13 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  31.21 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  31.39 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  30.7 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  32.24 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  29.9 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  30.97 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  30.39 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  30.39 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  32.48 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  32.8 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  29.84 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  32.81 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  30 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  29.35 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  30.25 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  29.31 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.29 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.03 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.1 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  31.34 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  30.39 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.77 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.91 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.63 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.91 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.91 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 320 aa  99.4  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  24.41 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.74 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.41 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  24.41 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.25 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  24.41 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  32.81 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  30.45 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  29.81 
 
 		 322 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.75 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  29.32 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  25.75 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  29.21 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  27.41 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  22.7 
 
 		 325 aa  85.9  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  28.36 
 
 		 326 aa  85.9  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  27.12 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  24.27 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  26.61 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  28.16 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  23.43 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  27.13 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  25.75 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  27.13 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  29.9 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  27.65 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  24.71 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  26.73 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  28.14 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.73 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  28.3 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  31.72 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  23.38 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>