156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0901 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
305 aa  596  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  99.02 
 
 
305 aa  591  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  75.66 
 
 
317 aa  447  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  75.08 
 
 
301 aa  441  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  71.15 
 
 
330 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  70.16 
 
 
305 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  64.12 
 
 
362 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  69.44 
 
 
332 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  69.1 
 
 
301 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  52.88 
 
 
300 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  53.87 
 
 
305 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  42.38 
 
 
350 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  43.23 
 
 
312 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  39.79 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  37.29 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  32.24 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  30.82 
 
 
305 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  33.79 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  31.6 
 
 
305 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  32.66 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  33.45 
 
 
314 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  33.89 
 
 
304 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  30.41 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  36.15 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  31.1 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  31.67 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  34.67 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  32.89 
 
 
307 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  29.12 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  28.94 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  33.78 
 
 
308 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  31.46 
 
 
306 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  31.58 
 
 
304 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.42 
 
 
336 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  29.9 
 
 
339 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  28.07 
 
 
310 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  30.21 
 
 
336 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  30.21 
 
 
336 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  32.04 
 
 
305 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  29.87 
 
 
302 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  32.38 
 
 
308 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  33.21 
 
 
304 aa  96.3  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  31.67 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  28.97 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  32.3 
 
 
304 aa  92.4  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  28.52 
 
 
314 aa  92.4  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.66 
 
 
315 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  27.7 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.66 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  24.41 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  26.26 
 
 
318 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  31.55 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.04 
 
 
315 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  26.26 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  28.52 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  32.89 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  26.35 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  25.32 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  28.12 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 
318 aa  79  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  25.96 
 
 
318 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  26.76 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  25.96 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  23.61 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  25.96 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.77 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  30.18 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  25.61 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  25.81 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  26.79 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  25 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  25 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  26.19 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  25.6 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.73 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  24.4 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  25.43 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  25.61 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  27.24 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  25.83 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  28.27 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.87 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  30.04 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.87 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  27.42 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.87 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  23.63 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  23.67 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  23.67 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  23.67 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  24.37 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  24 
 
 
316 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  22.33 
 
 
315 aa  59.3  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  27.8 
 
 
318 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  27.8 
 
 
318 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>