248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1531 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  100 
 
 
307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  32.24 
 
 
306 aa  140  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  31.91 
 
 
308 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  32.15 
 
 
304 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  32.36 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  32.03 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  30.03 
 
 
309 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  33.33 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  31.49 
 
 
303 aa  123  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  33.33 
 
 
308 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  27.54 
 
 
306 aa  122  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  33.11 
 
 
300 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  28.34 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  29.01 
 
 
315 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  29.76 
 
 
339 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  28.67 
 
 
308 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  32.2 
 
 
310 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  26.75 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.32 
 
 
336 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  29.49 
 
 
305 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  33.55 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  27.46 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  31.43 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  32.2 
 
 
336 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  32.2 
 
 
336 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  31.42 
 
 
319 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  28.29 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  29.75 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  27.48 
 
 
362 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  28.01 
 
 
305 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  30.54 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  28.96 
 
 
350 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  31.77 
 
 
307 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  29.84 
 
 
311 aa  105  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  30.94 
 
 
308 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  27.52 
 
 
315 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  30.3 
 
 
319 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  27.3 
 
 
310 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  30 
 
 
318 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  28.47 
 
 
318 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  31.14 
 
 
310 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  30.27 
 
 
313 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  29.97 
 
 
313 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  29.1 
 
 
318 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  30.13 
 
 
318 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.61 
 
 
312 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  29.49 
 
 
311 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  28.76 
 
 
318 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  29.1 
 
 
318 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  28.1 
 
 
313 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  28.1 
 
 
313 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  29.21 
 
 
304 aa  99.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  29.45 
 
 
316 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  29.53 
 
 
304 aa  99  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  28.05 
 
 
313 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  28.05 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  27.89 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  28.76 
 
 
318 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  30.72 
 
 
313 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  29.01 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  29.77 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  27.57 
 
 
299 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  26.53 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  28.81 
 
 
318 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  28.81 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  28.67 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  27.13 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  28.81 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  28.24 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  27.89 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  27.81 
 
 
317 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  27.87 
 
 
313 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  30.61 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  30.03 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  31.8 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  27 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  25.73 
 
 
330 aa  89.7  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  27.88 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  26.16 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.43 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  31.91 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  28.39 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  31.91 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  25.5 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  24.15 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  25.32 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  32.27 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  23.79 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  26.37 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  27.93 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  24.59 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  30.48 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  23.43 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  26.46 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  26.17 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  24.36 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  28.64 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  22.19 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.77 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  23.43 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>