211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0360 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  100 
 
 
311 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  64 
 
 
308 aa  332  7.000000000000001e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  46.98 
 
 
308 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  41.67 
 
 
310 aa  195  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  45.61 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  42.21 
 
 
307 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  39.93 
 
 
308 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  43.66 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  42.09 
 
 
305 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  42.61 
 
 
310 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  40.92 
 
 
309 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  42.91 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  43.66 
 
 
336 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  43.66 
 
 
336 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  38.87 
 
 
305 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  42.25 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  41.7 
 
 
315 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  43.61 
 
 
315 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  45.2 
 
 
310 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  41.34 
 
 
308 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  39.2 
 
 
305 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  37.01 
 
 
303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  39.53 
 
 
306 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  35.79 
 
 
310 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  41.95 
 
 
304 aa  159  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  38.08 
 
 
302 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  37.05 
 
 
303 aa  152  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  39.06 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  41.08 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  40.4 
 
 
314 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  37.85 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  41.28 
 
 
301 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  37.21 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  31.36 
 
 
306 aa  139  7e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  39.6 
 
 
304 aa  139  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  37.12 
 
 
312 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  35.19 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  43.21 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  35.27 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  33.11 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  34.35 
 
 
301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  37.68 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  32.65 
 
 
317 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  37.11 
 
 
273 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  32.66 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  31.99 
 
 
305 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  35.4 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  33.56 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  32.43 
 
 
362 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  33.56 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  30.14 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  30.48 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  29.79 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  29.79 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  32.78 
 
 
332 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  29.84 
 
 
307 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  29.25 
 
 
318 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  29.25 
 
 
318 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  29.25 
 
 
318 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  29.25 
 
 
318 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  31.97 
 
 
301 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  29.84 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  29.97 
 
 
319 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  28.82 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  33.69 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  33.69 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  30.72 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  30.39 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  30.62 
 
 
315 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  29.68 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  30.62 
 
 
313 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  34.04 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  27.93 
 
 
318 aa  93.2  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  28.82 
 
 
318 aa  92.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.41 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  29.24 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  28.52 
 
 
316 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  26.13 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  27.89 
 
 
318 aa  87  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  30.3 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  28.87 
 
 
319 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  31.08 
 
 
318 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  29.82 
 
 
318 aa  85.5  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  28.66 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  25.17 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  27.63 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  28.34 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.18 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  28.72 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  27.34 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  27.08 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  30.74 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  30.2 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.14 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.14 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.14 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  29.7 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.13 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.13 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.84 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>