180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3460 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 305 aa  594  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  73.11 
 
 		 330 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  70.16 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  70.16 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  69.44 
 
 		 317 aa  411  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  68.77 
 
 		 301 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  65.89 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  67.11 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  74.09 
 
 		 301 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  52.82 
 
 		 300 aa  275  9e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  54.93 
 
 		 305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  43.56 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  44.22 
 
 		 312 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  39.12 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  35.45 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  35.05 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  35.99 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  32.78 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  34.54 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  35.64 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  35.64 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  38.98 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  34.77 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  30.36 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  33.44 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  32.03 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  32.9 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  31.97 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  35.2 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  34.05 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  33.01 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  33.69 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  32.33 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  30.04 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  30.43 
 
 		 311 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  30.67 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  29.63 
 
 		 336 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  31.36 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  28.22 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  33.11 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  23.55 
 
 		 306 aa  95.9  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 336 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 336 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  37.41 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  28.48 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  28.15 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  28.15 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  27.15 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  28.15 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  31.14 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  27.41 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  31.2 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  31.27 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.97 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  27.48 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  32.41 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  31.9 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  25.69 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  27.78 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  25.86 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  25.78 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  27.3 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  25.95 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  25.75 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  25.78 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  25 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  24.84 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  23.62 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  24.51 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  26.25 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  25.51 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  25.33 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  25.49 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  25.93 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  30.1 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.23 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>