More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4040 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
318 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  86.12 
 
 
318 aa  554  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  83.33 
 
 
318 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  82.08 
 
 
318 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  75.63 
 
 
318 aa  495  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  75.63 
 
 
318 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  75.63 
 
 
318 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  32.35 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  31.7 
 
 
315 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  31.74 
 
 
315 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  33.66 
 
 
313 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  32.62 
 
 
310 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  31.1 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  30.52 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.93 
 
 
324 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  33.22 
 
 
309 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  31.37 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  31.37 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  29 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  29 
 
 
312 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  30.59 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  28.76 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
322 aa  112  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  29.22 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  29.9 
 
 
367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  28.01 
 
 
307 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  28.77 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  27.18 
 
 
308 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  29.97 
 
 
342 aa  109  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  29.97 
 
 
342 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  29.72 
 
 
305 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.04 
 
 
313 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  31.15 
 
 
299 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.87 
 
 
314 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  29.04 
 
 
308 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.79 
 
 
311 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  29.51 
 
 
329 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  27.59 
 
 
310 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  27.78 
 
 
325 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.63 
 
 
312 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.05 
 
 
309 aa  99.4  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.85 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  28.14 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  27.57 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  32.99 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  30.38 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  29.68 
 
 
321 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  27.87 
 
 
309 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  29.21 
 
 
313 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  27.71 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.26 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  29.37 
 
 
317 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  27.96 
 
 
306 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  27.21 
 
 
315 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.36 
 
 
314 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 
337 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  29.22 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  28.52 
 
 
315 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  29.28 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28.06 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  29.11 
 
 
311 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  26.86 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  26.86 
 
 
309 aa  87  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 
327 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  30.75 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.92 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.35 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  27.1 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  26.38 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  27.6 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  28.71 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  27.36 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  26.83 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  30.71 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  26.76 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.38 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.75 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  28.26 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  23.05 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  25 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  25.09 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  27.51 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  27.72 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.51 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  26.96 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  25.87 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  27.99 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  26.38 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  26.94 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  26.42 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  27.31 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  27.72 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  29.83 
 
 
322 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  22.95 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  28.57 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.42 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>