211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1263 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 319 aa  630  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  89.03 
 
 		 319 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  68.34 
 
 		 318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  69.91 
 
 		 318 aa  401  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  69.59 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  69.59 
 
 		 318 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  40.82 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  40.51 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  40.51 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  40.51 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  39.1 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  42.72 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  38.59 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  40.38 
 
 		 330 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  39.24 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  39.56 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  38.92 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  38.61 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  38.61 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  37.5 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  43.67 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  42.37 
 
 		 319 aa  222  7e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  39.68 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  35.74 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  40.4 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  44 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  38.54 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  37.05 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  37.7 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  36.93 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  36.93 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  36.6 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  35.95 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  38.28 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  36.07 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  34.63 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  35.16 
 
 		 315 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  33.78 
 
 		 312 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  34.55 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  29.25 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  33.11 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  31.42 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  32.41 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  35.71 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  29.23 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  30.9 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  33.67 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.74 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  29.08 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  34.98 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  33.81 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  34.98 
 
 		 315 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  29.97 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  23.88 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  27.4 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  27.96 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.88 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  31.01 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  31.77 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  31.01 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.92 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  28.81 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  29.19 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  27.09 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  28.92 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  24.66 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.47 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  29.01 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  27.82 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.83 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.24 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.26 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.26 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.26 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  31.02 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  26.44 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  25.89 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.43 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  28.78 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.27 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  22.53 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  27.34 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  26.43 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.02 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  23.93 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  27.17 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.38 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>