196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1893 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  100 
 
 
302 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  44.82 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  42.67 
 
 
309 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  45.8 
 
 
310 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  41.81 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  41.81 
 
 
310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  42.16 
 
 
339 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  41.81 
 
 
336 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  41.81 
 
 
336 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  42.67 
 
 
308 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  45.91 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  35.67 
 
 
306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  42.19 
 
 
305 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  40.14 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  43.46 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  38.03 
 
 
308 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  39.34 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  42.76 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  40.78 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  41.28 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  40.78 
 
 
308 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  35.5 
 
 
305 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  42.07 
 
 
314 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  36.16 
 
 
305 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  37.94 
 
 
303 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  42.07 
 
 
304 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  40.33 
 
 
304 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  35.12 
 
 
315 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  40.97 
 
 
304 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  42.28 
 
 
301 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  37.29 
 
 
310 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  38.08 
 
 
311 aa  153  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  36.58 
 
 
273 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  38.76 
 
 
350 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  39.6 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  34.75 
 
 
311 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  36.82 
 
 
299 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  37.5 
 
 
297 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  32.03 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  37.29 
 
 
312 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  33.12 
 
 
315 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  28.67 
 
 
316 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  33.33 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  30.36 
 
 
362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  30.2 
 
 
313 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  32.13 
 
 
330 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  34.04 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  30.82 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  31.13 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  33.94 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  30.72 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  31.06 
 
 
316 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  30.58 
 
 
313 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  27.36 
 
 
318 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  28.28 
 
 
316 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  30.38 
 
 
313 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  30.03 
 
 
313 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  28.19 
 
 
318 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  29.55 
 
 
305 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  28.72 
 
 
313 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  28.72 
 
 
315 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  28.08 
 
 
318 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  29.87 
 
 
305 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  27.42 
 
 
330 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  27.74 
 
 
318 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  28.77 
 
 
318 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  28.77 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  29.11 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 
319 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  28.42 
 
 
318 aa  99.4  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  27.4 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  29.32 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  25.86 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  26.49 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  25.75 
 
 
318 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  26.21 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  31.72 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  24.57 
 
 
318 aa  89.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.91 
 
 
315 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  30.16 
 
 
332 aa  85.9  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  26.46 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  29.28 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  32.74 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  32.74 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  33.1 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  23.94 
 
 
312 aa  79  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  29.78 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  30.54 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  29.14 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  27.05 
 
 
332 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.54 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  26.42 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  27.17 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.11 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  28.11 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.48 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.48 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  28.08 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.99 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>