268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1322 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  100 
 
 		 324 aa  630  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  40.45 
 
 		 315 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  39.16 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  40.78 
 
 		 314 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  41.39 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  35.22 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  34.56 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  34.9 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  34.9 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  33.45 
 
 		 325 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  31.35 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  30.13 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  29.77 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  29.77 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29.61 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  30.38 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  29.93 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28.9 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  31.8 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.91 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  29.25 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  30.37 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  29.81 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  30.52 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  30.98 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  30.23 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 310 aa  99.4  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  29.45 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  30.29 
 
 		 310 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 313 aa  95.9  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  28.89 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  28.81 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  28.29 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  26.81 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  30.87 
 
 		 316 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  27.38 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  29.58 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  29.28 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  28.76 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  30.15 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.43 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  28.33 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  29.58 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  23.13 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  26.87 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.66 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.61 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  27.88 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  29.93 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  29.77 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.68 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  26.73 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.65 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  27.48 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.34 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.68 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.34 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  28.81 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  26.06 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  26.45 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  26.69 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  27.81 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.74 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  26 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  29.67 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  28.08 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  26.42 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  28.11 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  28.44 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  28.36 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  26.59 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  22.4 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.13 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  30.07 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  29.15 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  25.39 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  23.55 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  24.54 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  22.53 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  29.15 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>