235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1383 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  54.93 
 
 		 309 aa  288  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  43.31 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  43.51 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  41.2 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  43.01 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  47.18 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  43.36 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  37.89 
 
 		 313 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  41.4 
 
 		 306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  39.33 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  41.4 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  39.58 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  42.16 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  39.86 
 
 		 308 aa  185  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  37.33 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  38.3 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  44.41 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  35.02 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  41.9 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  31.23 
 
 		 347 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  36.33 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  29.59 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  28.11 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  26.74 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  26.74 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.44 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.25 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  26.8 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.74 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.74 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  27.05 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.12 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  27.05 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  30.6 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.7 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.44 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  32.07 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  26.78 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.85 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  26.41 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  27.97 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.73 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  26.87 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.72 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  26.57 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  26.04 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  30.43 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  24.48 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  26.91 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  26.5 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  31.54 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  31.54 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  25.63 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.37 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.28 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  26.39 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  26.57 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  24.58 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  28.42 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.37 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.39 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  26.98 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  28.22 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  29.28 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.1 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  27.49 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.1 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  26.94 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.46 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  23.3 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  30.26 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  29.03 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  24.28 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  26.28 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  30.65 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  26.76 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>