168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0918 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  100 
 
 		 310 aa  612  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  57.01 
 
 		 308 aa  336  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  50.96 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  50 
 
 		 312 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  50 
 
 		 312 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  49.68 
 
 		 314 aa  281  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  49.11 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  34.41 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  32.11 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  33.12 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  33.12 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  31.91 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  29.61 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  28.2 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.81 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  28.2 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  28.28 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.95 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  27.51 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.14 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  29.13 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 305 aa  99  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  33.89 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.19 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  29.57 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.94 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.53 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.53 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  27.44 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.19 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  30.2 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  32 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  26.92 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  28.15 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  27.91 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  27.91 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  29.55 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  24.59 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  24.75 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.17 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  24.13 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  24.67 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  26.41 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  26.37 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.49 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  26.05 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  22.58 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  22.8 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  22.81 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  25.9 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.11 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.11 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  24.49 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.99 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.72 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  26.5 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  27.44 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  25.74 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  23.7 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  23.67 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  23.76 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  23.34 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  25.77 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  23.88 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  25.75 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.71 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  25.71 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  24.58 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  27.3 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  24.92 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  23.88 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  23.18 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  25 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  25.45 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  25.76 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.75 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  23.2 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.18 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  23.63 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  22 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  26.91 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  22.44 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  24.75 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  22.95 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  24.09 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  25.57 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  29.13 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>