273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2559 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  100 
 
 		 309 aa  593  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  62.42 
 
 		 313 aa  352  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  63.84 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  63.84 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  65.8 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  56.35 
 
 		 307 aa  325  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  59.93 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  41.97 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  41.78 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  37.34 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  40.66 
 
 		 316 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  39.29 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  36.66 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  32.43 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  31.97 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  33.55 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  32.67 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  30.35 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  34.1 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  31.82 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  31.48 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  31.37 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  31.09 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  34.41 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  31.31 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  31.79 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  34.74 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  31.91 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  30.79 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  31.46 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  29.29 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  30.69 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  30.59 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  32.12 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  30.82 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  30.13 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  30.13 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  35.37 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  30.16 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  31.65 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  30.91 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  31.61 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  30.6 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.63 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  31.65 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.3 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  32.54 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  31.27 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  28.89 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  25.72 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.79 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  29.39 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  29.01 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  29.01 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.59 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  31.19 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 313 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  26.5 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 313 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.62 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  30.72 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.12 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  31.21 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  27.76 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  33.94 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  27.13 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.81 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  30.84 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  28.91 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  26.48 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  26.5 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.79 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  28.39 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  29.71 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  29.71 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  28.38 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  26.18 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  30.91 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  27.47 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  28.71 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  27.96 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  26.45 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>