243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2339 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  100 
 
 		 308 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  76.95 
 
 		 308 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  56.82 
 
 		 306 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  48.7 
 
 		 305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  35.18 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  30.57 
 
 		 315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  30.57 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  32.47 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  30.25 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  31.58 
 
 		 318 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  31.68 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  31.35 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  31.35 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  28.98 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  29.04 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.42 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  26.54 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  31.17 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  31.34 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.81 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  29.13 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  28.48 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.96 
 
 		 315 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  27.83 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.21 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  30.5 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.28 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.36 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  26.89 
 
 		 329 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  26.98 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  26.4 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  26.56 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  27.36 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.05 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  26.21 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  29.59 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  24.52 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  26.76 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  27.03 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  23.59 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.68 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  25.94 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  23.4 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  21.75 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  24.32 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  23.3 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  25.57 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  26.75 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  24.36 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  25.57 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  24.13 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  24.37 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28.14 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  24.92 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  23.81 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  26.16 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  29.68 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  24.36 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.03 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  24.59 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.21 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  22.53 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  25.34 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  24.42 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  23.1 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  23.57 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  22.78 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  24.1 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  24.67 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  25 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25.61 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.79 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  21.52 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.56 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>