244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0677 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  100 
 
 		 312 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  99.68 
 
 		 312 aa  610  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  85.9 
 
 		 312 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  58.73 
 
 		 314 aa  350  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  51.6 
 
 		 308 aa  309  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  50 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  51.84 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  34.98 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  33.12 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  31.94 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  32.26 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  30.89 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  33.65 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  30.87 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  30.25 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  28.8 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  29.22 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  30.23 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  30.23 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  29.39 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  30.82 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  30.39 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  30.57 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  29 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.67 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  28.33 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  29.02 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.55 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.9 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.18 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.24 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.24 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  30.97 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  29.41 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  30.8 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  26.38 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  27.83 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  28.96 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.34 
 
 		 367 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25.81 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.03 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.88 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.15 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  24.04 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.53 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  28.18 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  26.22 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  28.15 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  25.25 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  26.45 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  26.94 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  25 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  28.76 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  25 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.38 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.75 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  23.65 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  23.31 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  25 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  24.26 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  26.57 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  24.45 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  25.9 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  27.69 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  26.75 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  29.46 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  25.8 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  26.19 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  24.03 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  26.6 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  24 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  23.47 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  24.45 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  21.81 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  21.81 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  25.63 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  23.64 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  27.31 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  28.51 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  21.74 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>