280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0241 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  100 
 
 		 314 aa  613  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  92.68 
 
 		 314 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  72.76 
 
 		 313 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  70.19 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  56.91 
 
 		 313 aa  328  7e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  56.45 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  51.92 
 
 		 319 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  56.13 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  50.79 
 
 		 317 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  53.29 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  50.34 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  49 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  48.46 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  45.6 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  42.02 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  29.45 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  29.13 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  30.55 
 
 		 320 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  30.35 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  29.77 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  32.13 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  29.74 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  28.8 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  28.8 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  28.48 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  31.8 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.69 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  35.58 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  33.01 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  32.09 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  31.72 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  31.76 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  29.47 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  33.64 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  30.29 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  30.82 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  31.86 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  33.64 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  30.57 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  30.77 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  30.32 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  30.16 
 
 		 309 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  27.18 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  31.76 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  32.91 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  27.88 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  30.7 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  29.14 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  30.84 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  30.84 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  30.3 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.16 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  29.52 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  30.39 
 
 		 330 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  32.46 
 
 		 318 aa  99.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  32.46 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  30.82 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  32.13 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  30.67 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 314 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.51 
 
 		 318 aa  95.5  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  27.05 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  28.01 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  31.16 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.4 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.34 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.42 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.73 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  26.2 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.34 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.66 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  27.92 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  27.95 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  25.47 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.11 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  31.66 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  31.29 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  29.63 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  26.03 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  31.79 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  28.86 
 
 		 325 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  24.16 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  30.55 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  30.16 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>