146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1866 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 347 aa  682    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  38.28 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  36.8 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  33.14 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  35.52 
 
 		 306 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  31.6 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  30.06 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  31.23 
 
 		 290 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  29.14 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  32.68 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  30.4 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  32.05 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  30.15 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  33.23 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  32.51 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  33.14 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  29.39 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  32.46 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  27.37 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  30.36 
 
 		 279 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  31.21 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.63 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.63 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  30.17 
 
 		 308 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  30.95 
 
 		 310 aa  93.2  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  27.83 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.83 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.01 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  28.81 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  29.82 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  30.36 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  26.79 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  26.86 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.15 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.71 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.26 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  26.55 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.86 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  31.14 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.66 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  24.71 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.82 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.73 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.1 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  28.61 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  25.07 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.53 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  23.65 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  23.65 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  25.88 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.13 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.17 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  25.71 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  29.82 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  25.35 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  26.02 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.42 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  30.32 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  23.65 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  25.39 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  25.39 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  31.18 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  23.73 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  23.96 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  25.39 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  25.22 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.99 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  23.03 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  25.98 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.03 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  23.03 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  23.28 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  30.94 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  30.94 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  24.78 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  27.17 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  26.65 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  24.65 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  25.77 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  30.9 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  29.6 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  25.45 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  23.71 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  22.97 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  20.8 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  22.92 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  25.62 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  21.37 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  22.73 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.13 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.35 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0694  auxin efflux carrier  23.55 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>