223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12560 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  100 
 
 		 308 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  45.1 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  44.22 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  41.03 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  44.41 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  44.41 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  40.21 
 
 		 290 aa  182  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  33.98 
 
 		 313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  33.02 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  38.51 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  37.94 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  36.48 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  35.81 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  33.33 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  37.7 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  33.97 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  41.08 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  38.33 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  38.17 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  36.96 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  34.39 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  30.17 
 
 		 347 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29.97 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  30.61 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.74 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.71 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  28.1 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.39 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  30.37 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.74 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  27.71 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  24.77 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  27.69 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  27.69 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  26.46 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  26.2 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  29 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  35.58 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  37.42 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  29 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  29.43 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  28.1 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  36.67 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  29.19 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25.23 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  27.69 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.46 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  25.23 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  27.49 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  23.57 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  22.73 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  26.06 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.19 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  22.36 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  21.45 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  27.02 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  25.87 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.1 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  35.83 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  25.61 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  29.05 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  30.92 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  23.65 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  25.61 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  26.02 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.93 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  25.64 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.72 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  34.87 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25.52 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  32.35 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  28.82 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  26.97 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.95 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  29.73 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.82 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  31.72 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  29.23 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.66 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  32.39 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>