194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0188 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 307 aa  599  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  43.37 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  40.51 
 
 		 309 aa  212  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  40 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  37.5 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  42.11 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  42.95 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  37.54 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  35.45 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  37.42 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  35.54 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  38.02 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  33.44 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  37.5 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  38.46 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  33.23 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  32.01 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  32.39 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  33 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  37.87 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  30.15 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  29.91 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  30.1 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  28.44 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.37 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  28.82 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.6 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  26.76 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  24.74 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  24.65 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  26.28 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.07 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  25.52 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  26.19 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  23.02 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  27.49 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.93 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  22.53 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  25.09 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.5 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.5 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  25.95 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.35 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  24.41 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  27.88 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  28.7 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  23.76 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  23.21 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  21.72 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  22.58 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  25.5 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  29.75 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  25.57 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  23.1 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  21.75 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  23.75 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  24.83 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  24.09 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  25.51 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  26 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  23.01 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  23.83 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  23.83 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  23.47 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25.67 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  21.43 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.65 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  21.92 
 
 		 313 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.94 
 
 		 313 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  25.11 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  23.79 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  24.59 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0694  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  27.49 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.16 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.07 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  23.53 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.09 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  28.27 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  27.98 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>