199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3876 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  100 
 
 		 318 aa  617  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  50.49 
 
 		 315 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  50.48 
 
 		 317 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  48.9 
 
 		 320 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  50.63 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  48.89 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  49.53 
 
 		 317 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  45.14 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  44.83 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  48.06 
 
 		 322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  34.44 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  31.05 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  31.82 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  32.55 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  31.77 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  31.77 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30.6 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.8 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  34.08 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  31.19 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.66 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  32.01 
 
 		 314 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  29.71 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  29.56 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  30.1 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  30.1 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  29.87 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  32.46 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  30.28 
 
 		 315 aa  99  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  31.75 
 
 		 310 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  30.34 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  31.61 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  32.79 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  29.81 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  30.37 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.5 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  27.36 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  31.27 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  32.01 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  29.94 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  27.42 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  31.89 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  30.25 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  30.35 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  30.72 
 
 		 372 aa  86.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  27.34 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.17 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  30.62 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  29.06 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  30.09 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  26.18 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  28.74 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  27.83 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  25.67 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  25.86 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  29.82 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.99 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  27.13 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.37 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.07 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  30.14 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.08 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  27.39 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.41 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.41 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  23.49 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  23.61 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  26.04 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  29.19 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  25.64 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  24.23 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  25.77 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  27.16 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.75 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  27.84 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  27.83 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  27.65 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  23.39 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  26.96 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  23.08 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  22.64 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  27.4 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  28.93 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>