222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49900 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49900  permease  100 
 
 		 377 aa  720    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  49.03 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  51.16 
 
 		 316 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  38.54 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  35.86 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  44.13 
 
 		 321 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  35.43 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  34.09 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  33.77 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  32.45 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  34.18 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  31.79 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  30.82 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.77 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  32.11 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  32.09 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  32.09 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.61 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  33.67 
 
 		 309 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 320 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  31.8 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.69 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  32.59 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  28.62 
 
 		 312 aa  99.4  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  32.59 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  25.99 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.83 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  28.96 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  31.61 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  29.49 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  29.49 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  31.96 
 
 		 337 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  29.93 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  26.38 
 
 		 320 aa  96.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  30.54 
 
 		 311 aa  96.3  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  31.27 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  30.1 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  26.23 
 
 		 322 aa  93.6  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  29.55 
 
 		 310 aa  93.6  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  32.3 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  29.53 
 
 		 318 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  31.1 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  31.1 
 
 		 309 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  32.14 
 
 		 322 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  28.95 
 
 		 314 aa  90.1  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.81 
 
 		 318 aa  89.7  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  30.67 
 
 		 309 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.82 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  29.1 
 
 		 311 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  30.41 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 309 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  28.1 
 
 		 314 aa  86.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  30.56 
 
 		 309 aa  86.7  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.47 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  30.07 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28.03 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  28.03 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  28.28 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  30.42 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.15 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  27.8 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  26.97 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.72 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.82 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  25.77 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  26.77 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  27.55 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  24.35 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  25.81 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  28.74 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  31.95 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  27.75 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  28.06 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  28.29 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  31.96 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.45 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  22.79 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  27.51 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.38 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.97 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 308 aa  67  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>