213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2164 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  100 
 
 		 321 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  51.09 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  42.59 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  44.13 
 
 		 377 aa  195  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  33.64 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  32.91 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  30.82 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  31.31 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.71 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  34.69 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  34.69 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  31.09 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30.85 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  30.93 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.35 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  30.64 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  30.67 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.52 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  27.25 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  26.43 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  27.41 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  34.26 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  28.3 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.3 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  29.81 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.94 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.6 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  30.15 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  28.33 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  28.75 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  31.27 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  30.89 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  30.24 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.16 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  26.23 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.69 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  24.14 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29.01 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  27.48 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.1 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.39 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  27.91 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  27.94 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  24.22 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.7 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  26.45 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  29.15 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  23.91 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  26.51 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  28.96 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  25.76 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  26.13 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  24.51 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25.81 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  26.01 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.42 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  26.99 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  27.49 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  25.63 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.72 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 325 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.12 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.72 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  30.82 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  28.29 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.66 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  25.87 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.32 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.4 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  25.34 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  27.8 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  26.94 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  26.72 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.31 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1706  Auxin Efflux Carrier  25.32 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  21.14 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  24.85 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  25.35 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  27.7 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  25.54 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.79 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  28.33 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>