138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1242 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  100 
 
 		 319 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  86.83 
 
 		 319 aa  544  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  89.34 
 
 		 319 aa  539  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1593  auxin efflux carrier  35.14 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1764  permease  25.56 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  26.3 
 
 		 314 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  26.3 
 
 		 314 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  26.3 
 
 		 314 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  30.06 
 
 		 313 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 332 aa  92.8  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1285  Auxin Efflux Carrier  26.3 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3604  putative transporter YfdV  26.3 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.290153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2659  putative transporter YfdV  26.3 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1297  putative transporter YfdV  26.3 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2522  putative transporter YfdV  26.3 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2741  putative transporter YfdV  26.3 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705582  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1706  Auxin Efflux Carrier  25.94 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  27.41 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.27 
 
 		 320 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.27 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.84 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.95 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  28.44 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  24.53 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  26.43 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.88 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.95 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  26.97 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  27.5 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  23.15 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0249  permease  30 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0415605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.4 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.42 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.4 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.1 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  30.08 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  24.01 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.69 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25.83 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  25.24 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  22.86 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  25.23 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  24.36 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  23.6 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.97 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  26.45 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.56 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  25.82 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  28 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.39 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.97 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.97 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  20 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  27.43 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  24.29 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 367 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  30 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  27.08 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  23.6 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.38 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  24.13 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.73 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  26.27 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  25.7 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  23.44 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  27.45 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  28.9 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  26.61 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  26.88 
 
 		 372 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  26.62 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  23.96 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  27.03 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.44 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  24.79 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  24.51 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  24.12 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  22.63 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  27.3 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  24.71 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>