228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3917 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  100 
 
 
310 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  41.48 
 
 
313 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  37.01 
 
 
316 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  35.43 
 
 
377 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  32.27 
 
 
315 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  32.92 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  33.97 
 
 
315 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  31.6 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  31.95 
 
 
313 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  29.55 
 
 
312 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  28.25 
 
 
311 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  30.29 
 
 
311 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  34.11 
 
 
330 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.89 
 
 
311 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  30.65 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  30.49 
 
 
313 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  29.45 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  31.02 
 
 
314 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.84 
 
 
316 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  31.62 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  27.91 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  30.09 
 
 
314 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  25.58 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  27.91 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.63 
 
 
319 aa  87  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.91 
 
 
332 aa  85.9  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 
320 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  31.83 
 
 
313 aa  85.9  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  26.98 
 
 
305 aa  85.5  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.27 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.27 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  28.09 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.97 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  24.43 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.65 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.55 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  26.27 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  24.76 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.41 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.48 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  29.81 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  24.75 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.39 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  27.52 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  24.92 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  27.52 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  24.03 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  29.8 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.41 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.38 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.28 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.43 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  24.84 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  26.09 
 
 
325 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  25.4 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  27.87 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  25.32 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  30.24 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.65 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  25.32 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  25.23 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  23.4 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  30.28 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  24.44 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  24.38 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  22.15 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  27.57 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  24.59 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  25.08 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  23.2 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  25.4 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  26.15 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  25.7 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.1 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  26.44 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  22.95 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.1 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  24.27 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  23.5 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  24.39 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  26.75 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  24.24 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  23.43 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  26.16 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  25.96 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  25.25 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  27.52 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  23.26 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  25.65 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  28.29 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  26.16 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1706  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  27.97 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  24.01 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>